PCR PCR Correção de problemas

PCR Problemas e Soluções, PCR Ajuda

What é seu PCR problema?:

Longa Não- específica PCR produtos?

Abecedário Moeda formação?

Problema:

longa Não- Específica Produtos em PCR

Quando correndo um agarose gel you mancha maior não- específica PCR bandos que não estão a direita tamanho.

Soluções sentir saudade Não- específica Produtos em PCR:

Decrescimento recozimento tempo

Decrescimento extensão tempo

Decrescimento extensão temperatura a 62-68º Celsus

Incremento KCl ( memória temporária) concentração a 1.2x-2x, mas manter MgCl2 concentração at 1.5-2mM

Incremento MgCl2 concentração até 3-4.5 mM mas manter dNTP concentração constante.

Uso menos abecedário

Presa menos DNA modelo

Presa menos Taq polímero

Se nenhum dos acima obras: confirmar a cartilha for repetitiva sequências ( bufo alinhar a sequência com a bancos de dados) e alteração as cartilhas()

Combinação de algum/ todas acima.

 

Problema:

PCR Abecedário Moeda

Quando correndo um agarose gel, you mancha algum muita pequena PCR bandos. Heis o tamanho dos seus abecedário ou por volta o tamanho de ambas seu abecedário ( um e B) junto. Heis termo " abecedário moeda" e são formado pela recozimento dos seus abecedário com ela mesma ou com a outro abecedário.

Soluções a abecedário moeda em PCR:

Uso menos abecedário.

Referente a- desenho abecedário e ordem um nova grupo. Certificar você usa abecedário desenho software e confirmar for si mesma- recozimento e que as cartilhas fazer não parte um grande percentagem de complementar sequência. Confirmar abecedário cuidadosamente for homo- moeda e hetero- moeda formação com OligoAnalyzer

Conduta PCR com e sem formamide.

Titrate Mg2+ (MgCl 1.5, 2.0, 2.5 e 3.0 mM) concentração.

Incremento DNA modelo monta ( concentração).

Incremento recozimento temperatura ( tentar optimizing usando um gradação PCR máquina encontrar ótima temperatura for recozimento).

Tentar adicionando DMSO até 5%.

Tentar usando Assunto picante PCR em lugar regular Taq polímero PCR.

 

Combinação de algum/ todas acima.