Τοποθετημένο pcr
Τοποθετημένο pcr
Καθορισμός τοποθετημένο pcr:
Τοποθετημένο pcr είναι μια παραλλαγή της αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσεων (pcr), δεδομένου ότι δύο ζευγάρια (αντί ενός ζευγαριού) pcr των εγχυτήρων χρησιμοποιούνται για να ενισχύσουν ένα τεμάχιο.
Το πρώτο ζευγάρι pcr των εγχυτήρων ενισχύει ένα τεμάχιο παρόμοιο με τυποποιημένο pcr. Εντούτοις, ένα δεύτερο ζευγάρι των εγχυτήρων κάλεσε τους τοποθετημένους εγχυτήρες (καθώς βρίσκονται/τοποθετούνται μέσα στο πρώτο τεμάχιο) δεσμεύει μέσα στο πρώτο pcr τεμάχιο προϊόντων για να επιτρέψει την ενίσχυση ενός δεύτερου pcr προϊόντος που είναι κοντύτερο από το πρώτο.
Το πλεονέκτημα τοποθετημένο pcr είναι ότι εάν το λανθασμένο pcr τεμάχιο ενισχύθηκε, η πιθανότητα είναι αρκετά χαμηλή ότι η περιοχή θα ενισχυόταν μια δεύτερη φορά από το δεύτερο σύνολο εγχυτήρων. Κατά συνέπεια, τοποθετημένο pcr είναι μια πολύ συγκεκριμένη pcr ενίσχυση.
Η τοποθετημένη pcr αντίδραση
Τοποθετημένο pcr απαιτεί δύο σύνολα εγχυτήρων που χρησιμοποιούνται για να ενισχύσουν ένα συγκεκριμένο τεμάχιο DNA χρησιμοποιώντας δύο χωρίζουν τα τρεξίματα pcr. Το δεύτερο ζευγάρι των εγχυτήρων λειτουργεί για να ενισχύσει ένα μικρότερο συγκεκριμένο τεμάχιο DNA που βρίσκεται μέσα στο πρώτο pcr προϊόν.
Τοποθετημένο pcr διάγραμμα αντίδρασης
Βήματα τοποθετημένο pcr
Βήμα ένα: Το πρότυπο στόχων DNA δεσμεύεται από το πρώτο σύνολο εγχυτήρων που παρουσιάζονται στο μπλε. Οι εγχυτήρες μπορούν να δεσμεύσουν στις εναλλακτικές, παρόμοιες περιοχές συνδέσεων εγχυτήρων που δίνουν τα πολλαπλάσια προϊόντα εντούτοις μόνο ένα από αυτά τα pcr προϊόντα δίνει την προοριζόμενη ακολουθία (πολλαπλάσια προϊόντα που δεν παρουσιάζονται).
Βήμα δύο: Pcr τα προϊόντα από την πρώτη pcr αντίδραση υποβάλλονται δεύτερο pcr που οργανώνεται εντούτοις με ένα δεύτερο νέο σύνολο εγχυτήρων που παρουσιάζονται στο κόκκινο.
Δεδομένου ότι αυτοί οι εγχυτήρες ΤΟΠΟΘΕΤΟΥΝΤΑΙ μέσα στο πρώτο pcr προϊόν, το καθιστούν πολύ απίθανο ότι το μη-συγκεκριμένα ενισχυμένο pcr προϊόν θα περιείχε τις περιοχές συνδέσεων και για τα δύο σύνολα εγχυτήρων. Αυτή η τοποθετημένη pcr ενίσχυση εξασφαλίζει ότι το pcr προϊόν από τη δεύτερη pcr ενίσχυση έχει ελάχιστη ή καμία μόλυνση από τα μη-συγκεκριμένα ενισχυμένα pcr προϊόντα από τις εναλλακτικές ακολουθίες στόχων εγχυτήρων.
Τοποθετημένο pcr πρωτόκολλο
Δείτε το τοποθετημένο pcr πρωτόκολλο
Τοποθετημένο pcr: Δημοσιεύσεις
Χρησιμοποιώντας τις τοποθετημένες αναλύσεις ρτ-πθρ για να καθορίσει την επικράτηση της αναφερόμενης στα πτηνά γρίπης β... Σχετικά άρθρα
Χρησιμοποιώντας τις τοποθετημένες αναλύσεις ρτ-πθρ για να καθορίσει την επικράτηση των αναφερόμενων στα πτηνά ιών γρίπης στα passerines στη δυτική Σλοβακία, κατά τη διάρκεια του καλοκαιριού 2007.
Το Scand j μολύνει το DIS. 2008 SEP 5;:1-4
Συντάκτες: Gronesova π, Kabat π, Trnka Α, Betakova τ
Η επικράτηση του αναφερόμενου στα πτηνά ιού γρίπης (AIV), μαζί με τη διανομή των διαφορετικών υποκατηγοριών AIV, μελετήθηκε στα μεταναστευτικά υδρόβια πουλιά και τα επίγεια πουλιά που πιάστηκαν στη δυτική Σλοβακία κατά τη διάρκεια του καλοκαιριού 2007, Και οι oropharyngeal και αμαρικές πατσαβούρες συλλέχθηκαν. Η διαλογή των δειγμάτων αποκάλυψε ότι 18% oropharyngeal και 18% των αμαρικών δειγμάτων ήταν θετικά για AIV. Τα δείγματα και από το στοματοφάρυγγα και από cloaca ήταν θετικά σε μόνο 6,6% των περιπτώσεων. Συνολικά 10 διαφορετικές υποκατηγορίες haemagglutinin (H2, H3, H4, H6, H7, H9, H10, H11, H12, και H13) και 4 διαφορετικές υποκατηγορίες neuraminidase (N1, Ν2, N3, και N5) ανιχνεύθηκαν σε 32 δείγματα από αυτήν την θέση. Οι αφθονότερες υποκατηγορίες του εκταρίου στα δείγματα ήταν H12 και H9 (25% κάθε), ακολουθούμενος από H11 και H10 (15% κάθε), και H13 (9%). Υπήρξαν 3 περιπτώσεις όπου οι διαφορετικές μολύνσεις AIV ανιχνεύθηκαν στα oropharyngeal και αμαρικά δείγματα που προέρχονται από το ίδιο πουλί (H13N1 και H12N5 H13N3 και H9N5 H10N2 και H9N5 στο στοματοφάρυγγα και cloaca, αντίστοιχα).
PMID: 18777249 [ PubMed - όπως παρέχεται από τον εκδότη ]