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La detección del papillomavirus humano en pterigio y papiloma conjunctival por… relacionó los artículos
Detección del papillomavirus humano en pterigio y papiloma conjunctival por la captura híbrida II y análisis de PCR.
Ojo. 6 Jun 2008;
Autores: Takamura Y, Kubo E, Tsuzuki S, Akagi Y
AimTo aclara el papel supuesto de la infección humana del papillomavirus (HPV) en pterigio y la captura conjunctival II (HC-II) de papilloma.MethodsHybrid y los análisis de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) fueron realizados para detectar HPV en el pterigio (42 muestras obtenidas a partir de 40 pacientes) y el papiloma conjunctival (8 muestras a partir de 6 pacientes). La cantidad de DNA de HPV fue evaluada por la medida de las unidades ligeras relativas (RLUs) en muestras de un papiloma de luminometer.ResultsAll era positiva para la DNA de HPV por PCR y HC-II. Los valores de RLU para los especímenes del papiloma recurrente y re-recurrente eran marcado más altos que ésos para los especímenes de lesiones primarias. HPV fue detectado por PCR en 2 de 42 (4.8%) especímenes beta-globin-positivos del pterigio, mientras que HC-II mostró que HPV era negativo en todos los resultados del pterigio samples.ConclusionsOur utiliza la hipótesis que la DNA de HPV está asociada a la patogenesia del papiloma conjunctival, pero no el pterigio. La medida de RLU por HC-II puede servir como etiqueta de plástico para evaluar la actividad de HPV en tumores conjunctival. Publicación en línea anticipada del ojo, 6 de junio de 2008; doi: 10.1038/eye.2008.176.
PMID: 18535585 [PubMed - según lo proveído por el editor]
metodología PCR-basada para la detección y la cuantificación moleculares del microchimerism. Artículos relacionados
metodología PCR-basada para la detección y la cuantificación moleculares del microchimerism.
Biol Med (Maywood) de Exp. 5 Jun 2008;
Autores: Pujal JM, Gallardo D
Antecedentes: El microchimerism periférico de la sangre después de que el embarazo o el trasplante sólido del órgano se haya estudiado extensamente solamente un consenso en su detección todavía no se ha adoptado. Objetivos: Para establecer un panel de los métodos PCR-basados moleculares reproductivos para la detección y la cuantificación de células no nativas en un individuo. Métodos: Analizábamos los polimorfismos de la longitud generados por STR y las etiquetas de plástico de VNTR. HLA-A y - los polimorfismos de B fueron detectados por RSCA. Los polimorfismos de la clase II en el lugar geométrico HLA-DRB1 eran analizados por PCR-SSP clásico y por PCR cuantitativo (Q-PCR). También, el gene de SRY permitió la discriminación y la cuantificación dispensadoras de aceite masculinas específicas por Q-PCR en recipientes femeninos. El análisis estadístico binomial de la distribución fue utilizado para cada técnica molecular para determinar el número de las réplicas de PCR de cada muestra. Este análisis permitió la detección del nivel perceptible más bajo del microchimerism, cuando presente. Resultados: Podríamos detectar microchimerism en más de 96% y más el de 86% de casos en los niveles tan bajos como el donante de 1:10 e5 y de 1:10 e6 por las células receptoras (DPRC) respectivamente, con Q-PCR para SRY o para los alleles no-compartidos HLA-DRB1. Estas técnicas permitidas tan bajo como 1 detección genoma-equivalente de la célula. Los niveles inferiores (nanochimerism) se podrían detectar pero no cuantificada debido a las limitaciones de la técnica. Por otra parte, los métodos clásicos de PCR permitieron la detección abajo a 1:10 e4 DPRC para HLA-DRB1 SSP-PCR. La aplicación clínica de estas técnicas en órgano sólido trasplantó los recipientes mostrados los niveles del microchimerism que se extendían de 1:10 e4 a 1:10 e6 DPRC después del trasplante del riñón o del corazón, y 1 registro más arriba (1: 10e3 a 1:10 e6 DPRC) después del trasplante del hígado. Conclusión: La estandardización de las técnicas moleculares de la detección del microchimerism permitirá la interpretación comparable de resultados en la detección del microchimerism para los estudios del diagnóstico o de la investigación.
PMID: 18535170 [PubMed - según lo proveído por el editor]
Arsenal en tiempo real de PCR para estudiar efectos de productos químicos en el hypothalamic-Pituita… Artículos relacionados
Arsenal en tiempo real de PCR para estudiar efectos de productos químicos en el eje Hypothalamic-Pituitario-Gonadal del medaka japonés.
Aquat Toxicol. 24 Abr 2008;
Autores: Zhang X, Hecker M, parque JW, Tompsett AR, Newsted J, Nakayama K, paladio de Jones, Au D, Kong R, Wu RS, Giesy JP
Este papel describe el desarrollo y la validación de un arsenal de PCR para estudiar efectos producto-inducidos sobre la expresión del gene de los caminos seleccionados de la endocrina a lo largo del eje hypothalamic-pituitario-gonadal (HPG) de los pescados pequeños, oviparous, el medaka japonés (latipes de Oryzias). El arsenal japonés del medaka HPG-PCR combina el funcionamiento cuantitativo de SYBR (R) PCR en tiempo real Verde-basado con el gene múltiple que perfila capacidades de un microarray para examinar perfiles de la expresión de 36 genes asociados a caminos de la endocrina en cerebro, hígado y gónada. El funcionamiento del arsenal japonés del medaka HPG-PCR fue evaluado examinando efectos de dos compuestos modelo, del estrógeno sintetizado, de 17alpha-ethinylestradiol (EE2) y del andrógeno anabólico, 17beta-trenbolone (TRB) en el eje de HPG del medaka japonés. el Cuatro-mes-viejo medaka fue expuesto a tres concentraciones de EE2 (5, 50, 500ng/L) o de TRB (50, 500, 5000ng/L) para 7d en un sistema estático de la exposición de la renovación. Un acercamiento camino-basado fue puesto en ejecución para analizar y para visualizar la expresión dependiente de la concentración del mRNA en el eje de HPG del medaka japonés. La respuesta compensatoria a la exposición EE2 incluyó la abajo-regulación del cerebro masculino GnRH RI y CYP17 testicular. La abajo-regulación de la expresión de la AR-alfa en el cerebro de los varones de EE2-exposed fue asociada a la supresión del comportamiento sexual masculino. Las respuestas compensatorias a TRB en el eje de la hembra HPG incluyeron la para arriba-regulación del cerebro GnRH RII y del ovario CYP19A steroidogenic. Totales, los resultados sugirieron que el arsenal japonés del medaka HPG-PCR tenga potencial no sólo como herramienta de la investigación de los productos químicos de endocrina-interrupción del potencial pero también en la aclaración de mecanismos de la acción.
PMID: 18534694 [PubMed - según lo proveído por el editor]
Un método eficiente para la purificación de los productos de PCR para ordenar. Artículos relacionados
Un método eficiente para la purificación de los productos de PCR para ordenar.
Biotechniques. El 2008 de junio; 44 (7): 921-3
Autores: MA H, Difazio S
Una DNA del alto-rendimiento de procesamiento que ordenaba el método que generó datos de la alta calidad fue desarrollada. Un marco formado de un gel estándar del agarose combinó con 0.1%-0.2% geles del agarose de la punta bajo-que derretían (LMP) fue utilizado aislar el producto de PCR del interés. Los productos recogidos de PCR fueron centrifugados sin ningunos reactivo y los supernatants fueron utilizados directamente para una reacción que ordenaba. Este método es eficiente simple y de trabajo, proporciona a secuencias de la alta calidad en un bajo costo, y desvía problemas con los productos impuros de PCR. Esta técnica se ha utilizado para el solo descubrimiento del polimorfismo del nucleotide (SNP) en árboles del angustifolia de Populus.
PMID: 18533902 [PubMed - en proceso]
La informática exacta y eficiente para usar cuantitativo del tiempo real PCR… Artículos relacionados
La informática exacta y eficiente para el tiempo real cuantitativo PCR usando un virus tripartito de la planta como modelo.
Biotechniques. El 2008 de junio; 44 (7): 901-12
Autores: Feng J, Zeng R, Chen J
PCR en tiempo real se está convirtiendo en un método preferido para la cuantificación de cantidades minuciosas de ácidos nucleic. Para alcanzar la capacidad máxima de esta técnica, los modelos exactos y convenientes para el análisis de datos del poste-PCR se requieren. En este estudio, tres diversos modelos fueron elegidos para cuantificar los números definitivos de la copia del virus del mosaico del pepino (CMV) RNAs genomic usando datos sin procesar de la fluorescencia de PCR en tiempo real, y las ecuaciones fueron propuestas para comparar sus niveles de la expresión en virions o en planta. Los resultados, según lo confirmado por la curva estándar y métodos que borran norteños, muestran que los niveles de la expresión de diversos genes se pueden comparar más exactamente y más eficientemente por estas ecuaciones, especialmente usando la fluorescencia teórica (F0) y los factores de la calibración (CF), determinados por la regresión linear PCR (LinRegPCR). Así, estas ecuaciones, combinadas con análisis de datos por el método de LinRegPCR, pueden realzar grandemente la capacidad de la cuantificación del alto-rendimiento de procesamiento de PCR en tiempo real, y permiten la investigación exacta, confiable, y fácil de los cambios en CMV la acumulación de RNAs.
PMID: 18533900 [PubMed - en proceso]