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  Papiers nouvellement édités de PCR - journal à jour

La détection du papillomavirus humain dans le pterygium et du papillome conjunctival par… a associé des articles

Détection de papillomavirus humain dans le pterygium et de papillome conjunctival par la saisie hybride II et les analyses de PCR.

Oeil. 6 jun. 2008 ;

Auteurs : Takamura Y, Kubo E, Tsuzuki S, Akagi Y

AimTo élucident le rôle putatif de l'infection humaine du papillomavirus (HPV) dans le pterygium et la saisie conjunctival II (HC-II) de papilloma.MethodsHybrid et les analyses de la réaction en chaîne de polymérase (PCR) ont été exécutées pour détecter HPV dans le pterygium (42 échantillons obtenus à partir de 40 patients) et le papillome conjunctival (8 échantillons provenant de 6 patients). La quantité d'ADN de HPV a été évaluée par la mesure des unités légères relatives (RLUs) sur des échantillons d'un papillome de luminometer.ResultsAll étaient positive pour l'ADN de HPV par PCR et HC-II. Les valeurs de RLU pour des spécimens de papillome récurrent et re-récurrent étaient nettement plus hautes que ceux pour des spécimens des lésions primaires. HPV a été détecté par PCR dans 2 de 42 (4.8%) spécimens bêta-globin-positifs de pterygium, tandis que HC-II a prouvé que HPV était négatif dans tous les résultats du pterygium samples.ConclusionsOur supporte l'hypothèse que l'ADN de HPV est associée à la pathogénie du papillome conjunctival, mais pas le pterygium. La mesure de RLU par HC-II peut servir de repère à évaluer l'activité de HPV dans les tumeurs conjunctival. Publication en ligne anticipée d'oeil, 6 juin 2008 ; doi : 10.1038/eye.2008.176.

PMID : 18535585 [PubMed - comme fourni par l'éditeur]

méthodologie PCR-basée pour la détection et la quantification moléculaires de microchimerism.

Biol Med (Maywood) d'Exp. 5 jun. 2008 ;

Auteurs : Pujal JM, Gallardo D

Fond : Le microchimerism périphérique de sang après que la grossesse ou la transplantation pleine d'organe ait été largement étudiée mais un consensus sur sa détection n'a pas été encore adopté. Objectifs : Pour établir un panneau des méthodes PCR-basées moléculaires reproductibles pour la détection et la quantification des cellules étrangères dans un individu. Méthodes : Nous avons analysé des polymorphismes de longueur produits par STR et des repères de VNTR. HLA-A et - des polymorphismes de B ont été détectés par RSCA. Des polymorphismes de la classe II sur le lieu HLA-DRB1 ont été analysés par PCR-SSP classique et par PCR quantitatif (Q-PCR). En outre, le gène de SRY a permis la discrimination et la quantification de distributeur mâles spécifiques par Q-PCR dans les destinataires féminins. L'analyse statistique binomiale de distribution a été employée pour chaque technique moléculaire pour déterminer le nombre de répliques de PCR de chaque échantillon. Cette analyse a permis la détection du niveau discernable le plus bas de microchimerism, quand présent. Résultats : Nous pourrions détecter le microchimerism dans plus de 96% et plus de 86% de cas aux niveaux aussi bas que le donateur de 1:10 e5 et de 1:10 e6 par cellules réceptives (DPRC) respectivement, en utilisant Q-PCR pour SRY ou pour les allèles HLA-DRB1 non-partagés. Ces techniques permises aussi bas que 1 détection génome-équivalente de cellules. Des niveaux plus bas (nanochimerism) pourraient être détectés mais en raison non mesuré des limitations de technique. D'une part, les méthodes classiques de PCR ont permis la détection vers le bas à 1:10 e4 DPRC pour HLA-DRB1 SSP-PCR. L'application clinique de ces techniques dans l'organe plein a transplanté les destinataires montrés des niveaux de microchimerism s'étendant de 1:10 e4 à 1:10 e6 DPRC après la transplantation de rein ou de coeur, et 1 logarithme naturel plus haut (1 : 10e3 à 1:10 e6 DPRC) après la transplantation de foie. Conclusion : L'étalonnage des techniques moléculaires de détection de microchimerism tiendra compte de la traduction comparable des résultats dans la détection de microchimerism pour des études de diagnostic ou de recherches.

PMID : 18535170 [PubMed - comme fourni par l'éditeur]

Alignement en temps réel de PCR pour étudier des effets des produits chimiques sur l'axe Hypothalamique-Pituitaire-Gonadal du medaka japonais.

Aquat Toxicol. 24 avr. 2008 ;

Auteurs : Zhang X, Hecker M, parc JW, Tompsett AR, Newsted J, Nakayama K, palladium de Jones, Au D, Kong R, Wu RS, Giesy JP

Cet article décrit le développement et la validation d'un alignement de PCR pour étudier des effets produit-induits sur l'expression de gène des voies endocriniennes choisies le long de l'axe (HPG) hypothalamique-pituitaire-gonadal des petits, oviparous poissons, le medaka japonais (latipes d'Oryzias). L'alignement japonais du medaka HPG-PCR combine l'exécution quantitative de SYBR (R) PCR en temps réel Vert-basé avec le gène multiple profilant des capacités d'un microarray pour examiner des profils d'expression de 36 gènes liés aux voies endocriniennes dans le cerveau, le foie et la gonade. L'exécution de l'alignement japonais du medaka HPG-PCR a été évaluée en examinant des effets de deux composés modèles, de l'oestrogène synthétique, de 17alpha-ethinylestradiol (EE2) et de l'androgène anabolique, 17beta-trenbolone (TRB) sur l'axe de HPG du medaka japonais. Le medaka âgé de quatre mois a été exposé à trois concentrations d'EE2 (5, 50, 500ng/L) ou de TRB (50, 500, 5000ng/L) pour 7d dans un système statique d'exposition de renouvellement. Une approche voie-basée a été mise en application pour analyser et visualiser l'expression dépendant de la concentration de mRNA à l'axe de HPG du medaka japonais. La réponse compensatoire à l'exposition EE2 a inclus le vers le bas-règlement du cerveau mâle GnRH RI et CYP17 testiculaire. Le vers le bas-règlement de l'expression d'AR-alpha dans le cerveau des mâles d'EE2-exposed a été associé à la suppression du comportement sexuel mâle. Les réponses compensatoires à TRB à l'axe de la femelle HPG ont inclus le vers le haut-règlement du cerveau GnRH RII et de l'ovaire CYP19A steroidogenic. De façon générale, les résultats ont suggéré que l'alignement japonais du medaka HPG-PCR ait le potentiel non seulement comme outil de criblage des produits chimiques de endocrine-perturbation de potentiel mais également en élucidant des mécanismes d'action.

PMID : 18534694 [PubMed - comme fourni par l'éditeur]

Une méthode efficace pour la purification des produits de PCR pour l'ordonnancement.

Biotechniques. 2008 juin ; 44 (7) : 921-3

Auteurs : MA H, Difazio S

Une ADN de haut-débit ordonnançant la méthode qui a produit des données de qualité a été développée. Une trame façonnée d'un gel standard d'agarose a combiné avec 0.1%-0.2% gel de bas-fonte d'agarose du point (LMP) a été utilisée pour isoler le produit de PCR d'intérêt. Des produits rassemblés de PCR n'ont été centrifugés sans aucun réactif et les supernatants ont été directement utilisés pour une réaction de ordonnancement. Cette méthode est efficace simple et de travail, fournit des ordres de qualité à un bas coût, et saute des problèmes avec les produits impurs de PCR. Cette technique a été utilisée pour la découverte simple du polymorphisme de nucléotide (SNP) dans des arbres d'angustifolia de Populus.

PMID : 18533902 [PubMed - dans le processus]

L'informatique précise et efficace pour le temps réel quantitatif PCR en utilisant un virus tripartite d'usine comme modèle.

Biotechniques. 2008 juin ; 44 (7) : 901-12

Auteurs : Feng J, Zeng R, Chen J

PCR en temps réel devient une méthode préférée pour la quantification des quantités minutieuses d'acides nucléiques. Pour réaliser la pleine capacité de cette technique, des modèles précis et commodes pour l'analyse de données de poteau-PCR sont exigés. Dans cette étude, trois modèles différents ont été choisis pour mesurer les nombres définitifs de copie de virus de mosaïque de concombre (CMV) RNAs genomic en utilisant des données crues de fluorescence de PCR en temps réel, et des équations ont été proposées pour comparer leurs niveaux d'expression dans les virions ou dans le planta. Les résultats, comme confirmés par la courbe standard et les méthodes épongeantes nordiques, prouvent que les niveaux d'expression de différents gènes peuvent être comparés plus exactement et plus efficacement par ces équations, particulièrement en utilisant la fluorescence théorique (F0) et les facteurs d'étalonnage (CF), déterminés par la régression linéaire PCR (LinRegPCR). Ainsi, ces équations, combinées avec l'analyse de données par la méthode de LinRegPCR, peuvent considérablement mettre en valeur la capacité de quantification de haut-débit de PCR en temps réel, et permettent la recherche précise, fiable, et facile sur les changements CMV de l'accumulation de RNAs.

PMID : 18533900 [PubMed - dans le processus]

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