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La rilevazione del papillomavirus umano in pterygium ed in papilloma conjunctival da… ha collegato gli articoli

Rilevazione del papillomavirus umano in pterygium ed in papilloma conjunctival dal bloccaggio ibrido II e dalle analisi di PCR.

Occhio. 6 giu. 2008;

Autori: Takamura Y, Kubo E, Tsuzuki S, Akagi Y

AimTo delucida il ruolo presunto dell'infezione umana di papillomavirus (HPV) in pterygium ed il bloccaggio conjunctival II (HC-II) di papilloma.MethodsHybrid e le analisi di reazione a catena della polimerasi (PCR) sono stati effettuati per rilevare HPV in pterygium (42 campioni ottenuti da 40 pazienti) ed in papilloma conjunctival (8 campioni da 6 pazienti). La quantità di DNA di HPV è stata valutata tramite la misura delle unità chiare relative (RLUs) sui campioni del papilloma di luminometer.ResultsAll era positiva per il DNA di HPV da PCR e da HC-II. I valori di RLU per gli esemplari del papilloma ricorrente e re-ricorrente erano contrassegnato superiori a quelli per gli esemplari delle lesioni primarie. HPV è stato rilevato da PCR in 2 di 42 (4.8%) esemplari beta-globin-positivi del pterygium, mentre HC-II ha indicato che HPV era negativo in tutti i risultati del pterygium samples.ConclusionsOur sostiene l'ipotesi che il DNA di HPV è associato con la patogenesi del papilloma conjunctival, ma non il pterygium. La misura di RLU da HC-II può servire da indicatore per la valutazione dell'attività di HPV in tumori conjunctival. Pubblicazione in linea di avanzamento dell'occhio, 6 giugno 2008; doi: 10.1038/eye.2008.176.

PMID: 18535585 [PubMed - come fornito a cura dell'editore]

PCR-ha basato la metodologia per rilevazione e quantificazione molecolari di microchimerism.

Biol Med (Maywood) di Exp. 2008 giugno 5;

Autori: Pujal JM, Gallardo D

Priorità bassa: Il microchimerism periferico di anima dopo che la gravidanza o il trapianto solido dell'organo ampiamente fosse stata studiata ma un consenso sulla relativa rilevazione ancora non è stato adottato. Obiettivi: Stabilire un pannello di molecolare riproducibile PCR-ha basato i metodi per rilevazione e quantificazione delle cellule straniere in un individuo. Metodi: Abbiamo analizzato i polimorfismi di lunghezza generati da STR ed indicatori del VNTR. HLA-A e - i polimorfismi di B sono stati rilevati da RSCA. I polimorfismi del codice categoria II sul luogo HLA-DRB1 sono stati analizzati sia da PCR-SSP classico che da PCR quantitativo (Q-PCR). Inoltre, il gene di SRY ha permesso la distinzione erogatrice maschio specifica e la quantificazione da Q-PCR in destinatari femminili. L'analisi statistica binomiale di distribuzione è stata usata per ogni tecnica molecolare per determinare il numero di repliche di PCR di ogni campione. Questa analisi ha permesso la rilevazione di più basso livello rilevabile di microchimerism, quando presente. Risultati: Potremmo rilevare rispettivamente il microchimerism più in di 96% e più di 86% dei casi ai livelli bassi quanto il donatore di 1:10 e5 e di 1:10 e6 per le cellule recettive (DPRC), usando Q-PCR per SRY o per gli alleli non-compartecipi HLA-DRB1. Queste tecniche permesse basso quanto 1 rilevazione genome-equivalente delle cellule. I livelli più bassi (nanochimerism) potrebbero essere rilevati ma non misurato dovuto le limitazioni di tecnica. D'altra parte, i metodi classici di PCR hanno permesso la rilevazione giù a 1:10 e4 DPRC per HLA-DRB1 SSP-PCR. L'applicazione clinica di queste tecniche nell'organo solido ha trapiantato i destinatari indicati i livelli di microchimerism che variano da 1:10 e4 a 1:10 e6 DPRC dopo il trapianto del cuore o del rene e 1 libro macchina più su (1: 10e3 a 1:10 e6 DPRC) dopo trapianto del fegato. Conclusione: La normalizzazione delle tecniche molecolari di rilevazione di microchimerism terrà conto l'interpretazione paragonabile dei risultati nella rilevazione di microchimerism per gli studi di ricerca o di diagnostico.

PMID: 18535170 [PubMed - come fornito a cura dell'editore]

Allineamento in tempo reale di PCR per studiare gli effetti dei prodotti chimici sull'asse Ipotalamico-Pituitario-Gonadico del medaka giapponese.

Aquat Toxicol. 24 apr. 2008;

Autori: Zhang X, Hecker m., parco JW, Tompsett AR, Newsted J, Nakayama K, palladio del Jones, Au D, Kong R, Wu RS, Giesy JP

Questo articolo descrive lo sviluppo e la convalida di un allineamento di PCR per studiare gli effetti prodotto-indotti sull'espressione del gene delle vie selezionate dell'endocrino lungo l'asse ipotalamico-pituitario-gonadico (HPG) di piccoli, pesci oviparous, il medaka giapponese (latipes di Oryzias). L'allineamento giapponese di medaka HPG-PCR unisce le prestazioni quantitative di SYBR (R) Verde-ha basato PCR in tempo reale con il gene multiplo che profila le possibilità di un microarray per esaminare i profili di espressione di 36 geni connessi con le vie dell'endocrino in cervello, fegato e gonade. Le prestazioni dell'allineamento giapponese di medaka HPG-PCR sono state valutate esaminando gli effetti di due residui di modello, dell'estrogeno sintetico, di 17alpha-ethinylestradiol (EE2) e dell'androgeno anabolico, 17beta-trenbolone (TRB) sull'asse di HPG del medaka giapponese. il Quattro-mese-vecchio medaka è stato esposto a tre concentrazioni di EE2 (5, 50, 500ng/L) o di TRB (50, 500, 5000ng/L) per 7d in un sistema statico di esposizione di rinnovamento. A via-ha basato il metodo è stato effettuato per analizzare e prevedere l'espressione dipendente dalla concentrazione del mRNA nell'asse di HPG del medaka giapponese. La risposta compensativa ad esposizione EE2 ha incluso la giù-regolazione del cervello maschio GnRH RI e CYP17 testicolare. La giù-regolazione dell'espressione dell'AR-alfa in cervello dei maschi di EE2-exposed è stata associata con soppressione di comportamento sessuale maschio. Le risposte compensative a TRB nell'asse della femmina HPG hanno incluso la in su-regolazione del cervello GnRH RII e dell'ovaia CYP19A steroidogenic. In generale, i risultati hanno indicato che l'allineamento giapponese di medaka HPG-PCR ha potenziale non solo come strumento della selezione dei prodotti chimici d'interruzione di potenziale ma anche nel delucidamento dei meccanismi di azione.

PMID: 18534694 [PubMed - come fornito a cura dell'editore]

Un metodo efficiente per purificazione dei prodotti di PCR per ordinare.

Biotechniques. 2008 giugno; 44 (7): 921-3

Autori: MA H, Difazio S

Un DNA di alto-rendimento che ordina il metodo in serie che ha generato i dati di alta qualità è stato sviluppato. Una struttura adattata da un gel standard dell'agarosi unito con 0.1%-0.2% gel difusione dell'agarosi del punto (LMP) è stata usata per isolare il prodotto di PCR di interesse. I prodotti raccolti di PCR sono stati centrifugati senza alcuni reagenti e i supernatants direttamente sono stati usati per una reazione ordinante. Questo metodo è efficiente semplice e di lavoro, fornisce le sequenze di alta qualità ad un basso costo ed esclude i problemi con i prodotti impuri di PCR. Questa tecnica è stata usata per la singola scoperta di polimorfismo del nucleotide (SNP) negli alberi di angustifolia di Populus.

PMID: 18533902 [PubMed - in lavorazione]

Elaborazione dei dati esatta ed efficiente per tempo reale quantitativo PCR usando un virus tripartito della pianta come modello.

Biotechniques. 2008 giugno; 44 (7): 901-12

Autori: Feng J, Zeng R, Chen J

PCR in tempo reale sta trasformandosi in in un metodo preferito per quantificazione degli importi minuscoli degli acidi nucleici. Per realizzare la piena capacità di questa tecnica, i modelli esatti e convenienti per analisi di dati dell'alberino-PCR sono richiesti. In questo studio, tre modelli differenti sono stati scelti per misurare i numeri definitivi della copia di virus del mosaico del cetriolo (CMV) RNAs genomic usando i dati grezzi di fluorescenza di PCR in tempo reale e le equazioni sono state proposte per confrontare i loro livelli di espressione in virions o in planta. I risultati, come confermati con la curva standard ed i metodi macchiantesi nordici, indicano che i livelli di espressione dei geni differenti possono essere confrontati più esattamente e più efficientemente da queste equazioni, particolarmente usando la fluorescenza teorica (F0) ed i fattori di calibratura (CF), determinati da regressione lineare PCR (LinRegPCR). Quindi, queste equazioni, unite con analisi di dati con il metodo di LinRegPCR, possono notevolmente aumentare l'abilità di quantificazione di alto-rendimento di PCR in tempo reale e consentono l'indagine esatta, certa e facile sui cambiamenti CMV nell'accumulazione di RNAs.

PMID: 18533900 [PubMed - in lavorazione]

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