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カのWuchereriaのbancrofti L3の幼虫の検出: 逆のTranscri… 関連の記事

カのWuchereriaのbancrofti L3の幼虫の検出: 逆のTranscriptase PCRの試金の評価の伝染およびInfectivity。

PLoS Negl Trop Dis。 2010年; 4 (2): e602

著者: Laney SJのRamzyのRM、Helmy HH、Farid HA、Ashour AA、Weil GJのウィリアムスSA

背景: PCRによるカのfilarial DNAの検出は感染させたカからの伝染性のカを区別できない。 とりわけ伝染性L3段階の寄生虫を検出できること伝達を評価するためには試金をある必要が危険にさらしなさい。 私達は今とりわけカのWuchereriaのbancroftiの伝染性の段階を検出する試金の開発を報告する。 試金は逆transcriptase PCR (RT-PCR)によってL3作動したmRNAのコピーを検出する。 METHODOLOGY/PRINCIPALの調査結果: W.のbancroftiのクチクラ関係した遺伝子は生物情報学を使用して選ばれ、カのL3検出のための潜在的な診断ターゲット遺伝子として選別した。 表現のプロフィールは感染させた血の挿入の後で2週間のピリオドを渡って毎日集められたカから隔離されたRNAのRT-PCRを使用して断固としただった。 慣習的なマルチプレックスRT-PCRおよびリアルタイムマルチプレックスRT-PCR試金はL3検出のためのL3作動したcuticlinのコピーおよび本質的に表現されたコピー、「段階」の検出のためのtph-1を使用して、開発された。 CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: この試金が同時にW.のbancroftiの分かち合われたベクトルカの伝染性の段階の幼虫そして「段階」の幼虫を検出するのに使用することができる。 このテストは査定のためのツールがfilariasisの除去プログラムという点において伝達潜在性で変更すると同時に有用かもしれない。

PMID: 20169115 [PubMed -プロセスの…]

商業PCRの酵素のHIVの汚染は低価格の社内遺伝子型HIVの薬剤の耐性検査の品質管理の重要性を上げる。

そこのAntivir。 2010年; 15 (1): 121-6

著者: Monleau M、Plantier JC、Peeters M

背景: 研究だけのための品質のラベルが付いている遺伝子型薬剤抵抗のテストの使用の試薬のための低価格の社内技術。 ここでは、私達は2つの独立した実験室で観察された否定的制御のPCRの拡大の結果で報告する。 方法: 乾血や血しょう点のHIVの遺伝子型薬剤抵抗のテストのためのプロテアーゼの肯定的なPCRの拡大はそして逆のtranscriptaseのフラグメント否定的制御サンプルで観察され、PCRによってPCRの汚染の起源を識別するためにおよびシーケンスおよび系統発生の分析詳しく分析された。 結果: 詳細解析はRT-PCRの酵素が同じ会社が商業化したHIV基づかせていたベクトルと汚染されたことを明らかにした。 結論: これらの観察はこれが社内プロトコルを使用してかなりHIVおよび遺伝子型薬剤の耐性検査の分子診断を妥協できるので新しい試薬のバッチのHIVの不在のために確認する品質管理のステップを実行する必要性を示す。

PMID: 20167998 [PubMed -プロセスの…]

新しい混合されフォーマットネザーランドの臨床隔離集団間のマルチトリアゾールの抵抗のコウジカビのfumigatusそして流行のトリアゾールへの突然変異の相談の抵抗を検出するリアルタイムPCRの試金。

J Antimicrob Chemother。 2月2010日18日;

著者: Klaassen CH、de Valk HA、Curfs-Breuker IM、Meis JF

目的はこの調査の目標次のとおりだった: (i)ネザーランドのトリアゾール抵抗力があるコウジカビのfumigatusの隔離集団の流行を調査するため; そして(ii)急速なリアルタイムPCR方法をそのような物を識別するように設計するため隔離集団。 方法A新しい混合されフォーマットリアルタイムPCRの試金はA.のfumigatusでトリアゾールの抵抗の原因となる突然変異の検出のために記述されている。 1組のPCRのプライマーおよびdouble-stranded DNAの蛍光染料と組み合わせて単一の蛍光ラベルを運ぶプローブは(a)内部拡大制御として役立つ増幅された製品のと同様、特定の突然変異の同時検出を可能にする。 方法はネザーランド全体のから209の臨床隔離集団の任意コレクションに適用され、表現型耐障害性のテストと比較された。 4つのトリアゾール抵抗力がある隔離集団のAの<2%の抵抗力がある隔離集団の流行に終って識別された、合計は生じる。 4つの隔離集団はすべて他前に報告されるようにマルチトリアゾールの抵抗の、原因となる突然変異の同一の組合せを含んでいた。 分子試験結果は表現型耐障害性のテストと一致した100%だった。 特定の患者数にA.のfumigatusの抵抗の流行は出現問題であるかもしれないが一般群衆の結論まだ比較的低い。 新しいリアルタイムPCRのフォーマットはそのような物の急速な、信頼できる識別を隔離集団可能にする。

PMID: -出版業者によって供給される… 20167588 [PubMed]

16S rRNAおよびギャップの遺伝子のPCR-RFLPでovineミルクのサンプルから隔離されるcoagulase-negativeぶどう状球菌の識別。

獣医Microbiol。 1月2010日28日;

著者: Onni T、Sanna G、Cubeddu GP、Marogna G、Lollai S、Leori G、Tola S

ovine伝染を引き起こすcoagulase-negativeぶどう状球菌により(CNS)の識別はこれらの細菌がヒツジおよびヤギの潜在性の乳房炎の主要で病因学的なエージェントとして考慮されるが、問題となる残る。 この調査では、226のCNSの隔離集団は高い体細胞のカウントのスコアを持つ15群に属している2201頭の搾り出すsardaのヒツジから集められた。 次にすべての隔離集団はPCRの試金によってAPIのぶどう球菌IDテストが付いている識別とstaphylococcal 16S rRNAおよびギャップの遺伝子の拡大に服従した。 ギャップの遺伝子は制限のendonuclease AluIとの制限のフラグメントの長さの多形の分析に16S rRNAの遺伝子が制限のendonucleases RsaI、PstIおよびAluIとのribosomal指紋採取に服従した一方、服従した。 CNSの隔離集団のPCR-RFLPパターンが参照の緊張のそれらと異なっていたときに、ギャップの遺伝子のampliconsは限定的な識別のために配列された。 遺伝子型識別方法への代わりのAPIのぶどう球菌IDテストは、各グループの内で識別された種の点では、かなり異なった結果を生んだ。 PCR-RFLPの試金を使用して、隔離集団のほとんどはぶどう状球菌のepidermidiのタイプ緊張(57.9%に相当して131、)とともにS.のcaprae (15%に相当して34、)およびS.のchromogenes (13.2%に相当して30、)によって、続いた群がった。 結論として、16S rRNAのPCR-RFLPの試金およびギャップの遺伝子はヒツジの乳房炎を引き起こすCNSの識別によりのためのAPIのぶどう球菌IDテストより信頼でき、再生可能な方法である。

PMID: -出版業者によって供給される… 20167442 [PubMed]

glioblastomaのO6 methylguanineDNA methyltransferaseの促進者のメチル化の分析: ロックされた核酸による検出は捺印された遺伝子(SNURF)を使用して参照として量的なPCRを基づかせていた。

BMCの蟹座。 2月2010日18日; 10 (1): 48

著者: Morandi L、Franceschi E、De Biase D、Marucci G、Tosoni A、Ermani M、Pession A、Tallini G、Brandes AA

概要: 背景: 促進者のメチル化によってMGMTの遺伝子の後成の沈黙は、放射線療法に加えて、carmustineまたはtemozolomideのアルキル基を導入する化学療法を受け取ったglioblastomaの患者のMGMTの表現、減少されたDNA修理作業およびより長く全面的な存続の損失と関連付けられる。 私達はロックされた核酸(LNA)の修正されたプライマーおよび捺印された遺伝子を使用して参照として急速なメチル化敏感で量的なPCRの試金(氏qLNAPCR)を記述し、認可する。 方法: 分析は2004年4月と2008年10月の間に続かれた159人のGBMの患者のデータベースのなされた。 重亜硫酸塩の処置の、メチル化され、unmethylated CpGsの後でLNAのプライマーおよび分子標識のプローブによって認識された。 15q12でマップされた参照として捺印された遺伝子のSNURFの促進者は使用された。 このアプローチは捺印された遺伝子にメチル化され、unmethylated対立遺伝子の釣り合った限定番号がある、この機能は容易で、精密な標準化を可能にするので使用され。 結果: 既に記述されていた入り込まれたMS-PCRと氏qLNAPCR間の用語索引は159のサンプル(99.4%)の158で見つけられた。 氏qLNAPCRの試金は非修飾プライマーは低効率(69%)およびより低い感度(0.1%)を明らかにしたが102%のPCRの効率およびLNAのための0.01%の感度がプライマーを修正したことを示した。 MGMTの促進者は70人の患者(44.02%)の氏qLNAPCRを使用してメチル化され、完全に89のサンプル(55.97%)でunmethylated見つけられた。 中央の全面的な存続は24か月のあり、unmethylated、メチル化されたMGMTの患者の20か月そして36か月、それぞれである。 MGMTのメチル化データを考慮することは二値変数として氏qLNAPCRによって提供した、全面的な存続はunmethylated MGMTの促進者を隠すGBMのサンプルを持つ患者とMGMTのメチル化(p=0.003)のあらゆるパーセントの他の患者間で異なっていた。 この相違は他を使用してMGMTによってメチル化された対立遺伝子の50%が締切りとして使用されたときに相違は失われたが、MGMTのメチル化率のための断ち切られた値(メチル化された対立遺伝子のすなわち10%そして20%)保たれた。 結論: 私達はGBMのサンプルのメチル化されたMGMTの対立遺伝子の検出そして定量化のための正確で、強い、費用有効氏qLNAPCRのプロトコルを報告し、臨床的に認可する。 氏qLNAPCRを使用して私達はtemozolomide化学療法への応答を予測するためにMGMTの促進者のメチル化の低水準が考慮に入れられなければならないことを示す。

PMID: -出版業者によって供給される… 20167086 [PubMed]

PCRの拡大および高リゾリューションの溶解はマイコバクテリウムのavium-intracellulareの複合体の遺伝子型のメンバーに急速な診断方法として分析を曲げる。

Clin Microbiolは感染する。 2月2010日17日;

著者: Castellanos E、Aranaz A、De Buck J

マイコバクテリウムのavium-intracellulare (MAI)の複合体のメンバーの何人かimmunocompromised、immunocompetent患者の人間の病原体として認識される。 遺伝子型に使用できるMAIの複雑なメンバー現在の分子方法は高く、技術的にデマンドが高い場合もある。 このレポートでは、私達はPPEの(プロプロGlu)遺伝子グループ、MACPPE24のメンバーを目標とすることによって複雑なメンバーの間で区別するためにリアルタイムPCRおよび高リゾリューションの溶解のアプローチのアプリケーションをはじめて記述する。 この目標では技術を最適化するのに、マイコバクテリウムのaviumの亜種およびマイコバクテリウムのintracellulare (M.のintracellulare)の参照の緊張が使用された。 それから、このリアルタイムPCR-HRMのアプローチが10マイコバクテリウムのaviumの亜種のhominissuisを区別するのに守備につくM.のintracellulareの参照の緊張からの隔離集団の使用された。

PMID: -出版業者によって供給される… 20167007 [PubMed]

版権2006-2007年のPCR端末