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  새로 간행된 PCR 종이 - 경신된 일간신문

브라질 H의 대뇌 주혈 원충병 진단에 있는 실시간 양이 많은 PCR…

브라질 HIV 감염된 환자의 대뇌 주혈 원충병 진단에 있는 실시간 양이 많은 PCR.

J Med Microbiol. 2월 2010일 11일;

저자: Mesquita RT, Ziegler AP 의 Hiramoto RM, Vidal JE, Pereira-Chioccola VL

대뇌 주혈 원충병은 HAART에 자유 접근에도 불구하고 높은 사망 그리고 사망률을 가진 브라질에 있는 후천성 면역 결핍증 환자에 있는 일반적인 대뇌 대량 병변, 이다. 전통적인 PCR (cnPCR) 또는 실시간 양이 많은 PCR (qrtPCR)에 근거를 둔 분자 진단은 계속 결정적인 진단에 불가결 이다. 우리는 혈액에 있는 qrtPCR와 브라질에 있는 후천성 면역 결핍증 환자에게서 뇌척추 액체 (CSF) 견본의 평가를 여기서 보고한다. 이 추적 연구는 2 년간 수행되, 확인된 임상과 방사선학적인 진단을 가진 149명의 후천성 면역 결핍증 환자 (98의 혈액과 51의 CSF 견본)에게서 추출된 DNA 견본을 분석한. 실험실 진단은 cnPCR (놓이는 B22/B23가 뇌관)와 간접 면역 형광검사를 포함했다 (만일). qrtPCR를 위해, 2개의 뇌관 세트는 TaqMan MGB 조사 FAM를 사용하여 염색하 레테르를 붙인 이전에 기술된 유전자에서 동시에 디자인되었다. 하나는 B1 유전자에서 순서를 증폭한 B1Tg이었다. 그 외는 529 bp 순서의 PCR 제품을 증폭한 RETg이었다. 전반적인 cnPCR와 qrtPCR 결과는: 긍정적 결과는 33.6%에서 관찰되었다 (50명의 환자). 감도는 cnPCR (B22/B23)를 위해 98%, qrtPCR를 위해 86% 및 98%이었다 (B1Tg와 RETg, 각각). 부정적인 반응은 66.4%이었다. 특이성은 cnPCR와 qrtPCR (B1Tg)를 위해 97%이었다; 그리고 RETg를 위해 88.8%. 이 데이터는 많은 사본을 가진 반복 지구를 증폭하기 때문에 RETg가 매우 민감하다는 것을 보여준다; 그러나, 그것의 특이성은 다른 마커 보다는 더 낮다. 다른 손에서, B1Tg에는 좋은 특이성, 그러나 더 낮은 감도가 있었다. 환자 사이에서, 20에는 혈액이 있고 CSF는 동시에 모았다. 따라서, 그들의 결과는 저희가 잘 laboratorial와 임상 진단의 다른 대본 이해를 위한 분자의, 혈청학과 임상 진단을 분석하고 비교하는 것을 허용했다. 확인된 대뇌 주혈 원충병 진단을 가진 9명의 환자를 위해, 4개의 대본은 관찰되었다: I와 ii- CSF에 있는 부정적인 분자 진단 및 가변을 가진 혈액에 있는 포지티브 만일 혈청과 CSF에 있는 역가인 경우에; CSF에 있는 iii- 긍정적인 분자 진단 및 혈액에 있는 네거티브; 그리고 두 견본 전부에 있는 iv 긍정적인 분자 진단. 후반 2개의 상황에서는, 혈청에 있는 역가와 CSF가 변하기 쉬운 경우에 일반적으로. 다른 기회주의 감염은 11명의 환자에서 보였다. 에도 불구하고 혈청에 있는 역가에는과 변하기 쉬운 CSF에는 두 견본 전부에 있는, 모두 부정적인 분자 진단이 있던 경우에. qrtPCR는 T. gondii DNA 입원 환자 견본의 급속한 ID를 허용하고 케이스의 소수 민족에서 어긋남은 cnPCR로 생긴다.

PMID: - 발행인에 의해서 공급되는 - 20150319 [PubMed]

유럽 약전 단면도 2.6.7에 따라 mycoplasmas의 탐지를 위한 PCR 방법의 타당성 검사.

Biologicals. 2월 2010일 9일;

저자: Zhi Y, Mayhew A, Seng N, Takle GB

유럽 약전 [1]에 있는 mycoplasma 테스트를 위한 수정된 단면도의 최근 간행물은 biologics 약에 있는 mycoplasma 오염물질의 탐지에 있는 사용을 위한 핵산 확대 기술 (NAT)를 유효하게 하기에 관심을 끌기 위하여 지도했다. PCR 근거한 방법을 가진 존재 문화 근거한 방법의 보충에는에 의하여 또는 supplementation에는 결과 및 잠재적으로 낮아진 비용을 위한 감소된 반환 시간에 관하여 biopharmaceutical 기업을 위한 몇몇 이점이, 주로 있다. PCR 방법으로 기존 방법의 보충 또는 대용암호는 탐지 (LOD)와 특이성의 동등한 분석실험 한계의 데몬스트레이션을 요구한다. 이 비교할 수 있음 타당성 검사를 위한 실험적인 필요조건은 상기 참조 사항를 붙인 EP 단면도에서 상세히 열거되었다. 이 간행물에서는, 우리는 EP 지도에 따라 정확하게 실행된 PCR 방법의 타당성 검사와 비교할 수 있음 분석을 기술한다. 이 타당성 검사 활동의 완료는 mycoplasma 검출 방법을 위한 EP 수락 요구에 응하거나 초과하는 분석실험의 가용성 귀착되었다.

PMID: - 발행인에 의해서 공급되는 - 20149967 [PubMed]

실시간 PCR를 사용하는 unpurified 메티실린 저항하는 황색포도상구균 (MRSA) DNA의 소형 에 칩 탐지.

J Biotechnol. 2월 2010일 8일;

저자: 집 DL, Chon CH 의 Creech 콜럼븀, Skaar EP, Li D

이 서류는 microfluidic 시스템에서 메티실린 저항하는 황색포도상구균 (MRSA)의 3개의 양식을 검출하는 기능을 평가한다. MRSA는 다양한 수준의 견본 준비에 의해 준비한 off-chip이었다: 포함하는 누구든개는 genomic DNA, 간단한 시약을 사용하여 조잡한 준비의 상청액을, 및 비등한 문화 준비를 통해서 어떤 추가 시약도 없이 세 번째를 포함하는 또 다른 한개 순화했다. Polydimethylsiloxane (PDMS) microfluidic 칩은 연약한 석판인쇄술을 사용하여 날조되고 22x22x0.1mm 커버 유리 미끄러짐에 그 후에 접착되었다. 유사한 방식으로 날조된 뚜껑은 압축 도중 정지되는 잘 근거한 칩에 있는 거품 대형 그리고 증발을 방지하기 위하여 사용되었다. 저항하는 히이터에 근거를 둔 소형 열 cycler 및 작은 팬은 폴리메라이제 연쇄 반응을 위한 요구된 온도를 통해 순환하기 위하여 이용되고 형광성 강렬 측정은 각 주기에 취했다. 템플렛의 각 양식은 (젤 전기 이동법으로 검증되는) 개발한 마이크로 PCR 시스템을 제공했다 이용하는 긍정적 결과를. 순화한 genomic DNA의 연속되는 희석은 1.77의 효율성을 표준 곡선을 제공했다. 명확한 긍정적 결과를 제공한 가장 낮은 농도는 DNA의 11.2pg를 포함하는 3muL 견본에서 왔다. 최소 견본 준비를 치루는 견본에 있는 MRSA를 검출하는 기능은 감염성 생물 확인 가능한 점 의 배려 검출 시스템의 발달에 있는 필요한 단계이다.

PMID: - 발행인에 의해서 공급되는 - 20149828 [PubMed]

mycoplasma 터치다운 PCR 분석실험을 위한 타당성 검사 그리고 국제적인 규정하는 경험.

Biologicals. 2월 2010일 9일;

저자: Asarnow D, Warford A, Fernandez L, Hom J, Sandhu G, Candichoy Z, Luna G, Goldman M, Rarich R

PCR 분석실험은 mycoplasma 오염을 위한 rFVIII 생산 fermenters를 감시하기 위하여 개발되었다. 방법은 16S rRNA 유전자에 특정 뇌관으로 품질 "터치다운" (TD) PCR 프로토콜에 선행된 간단한 적출 절차를 이용한다. 방법에는 mycoplasma 종의 광범위를 검출하는 수용량이 있다. 타당성 검사는 ICH 지침서에 따라 실행되고 견본의 ml 당 못을 박은 579와 1715년 mycoplasma 게놈 사본 사이의 탐지의 한계를 확인하고, 더 중대한 특이성을 그램 양성 박테리아와 비교된 1000 10,000 접히십시오. 비교할 수 있음 연구 결과에서는, 그것은 현재 FDA 추천한 국물에 감도에서 대등하 한천은 단위 (cfu) /ml를 형성해 1명의 식민지에게 방법의 아래로 문화 기초를 두었다. 방법은 일상적인 fermenter 감시 도중 문화 근거한 mycoplasma 탐지를 위한 보충으로 그것의 예정된 사용을 위해 유효하게 했다. 방법을 위한 정식 인가는 중요한 지구의 많은 것에서 얻어지고 활동은 진행한다 문화 근거한 분석실험에 방법의 탐지의 비교 한계에 대하여 기관 관심사를 언급하기 위하여.

PMID: - 발행인에 의해서 공급되는 - 20149683 [PubMed]

닭 종축에 있는 Mycoplasma gallisepticum의 진단을 위한 실시간 PCR 문화 그리고 혈청학은 무리를 짓는다.

수의사 Microbiol. 1월 2010일 28일;

저자: Kahya S, Temelli S, Eyigor A, Carli KT

이 연구 결과는 혈청학에 향상한 탐지 한계와 실시간 PCR (rPCR) 시험 및 닭 종축 무리에 있는 Mycoplasma gallisepticum (MG) 감염의 탐지를 위한 문화를 비교하는 것을 작정이었다. 31 조부모 닭 종축 무리에 속하는 600 그리고 46 혈액 및 기관 면봉 견본은 rPCR에 의해 시험되었다. rPCR의 탐지 한계는 순수한 MG S6 긴장 DNA 및 100colony가 0.9pgmul (- 1), 단위 (CFUs 형성하는 상태에서) ml를 (- 순수 배양 둘 다 및 기관 면봉이 동일한 긴장으로 인위적으로 못을 박은 곳에, 1)이었다. 양성 혈청 무리는 MG 둘 다 RPA에 기초를 두어 평가하고 문화 및 rPCR 긍정적인 무리 비율 16.1% (5/31) 및 29.0%는 (9/31)이었는 그러나, HI는 48.4% (15/31)와 32.3%로 (10/31), 각각 각각 산출되었다. 무리 근거한 분석에, 문화 방법은 10 MG 양성 혈청 무리 (감도 50%, 특이성 100%년) 중에서 rPCR가 10 무리 (감도 80%, 특이성 95%) 중에서 8장의 검출했더라도 반면, 5장의 검출했다. 혈청학 사이 계약과 문화, 와 혈청학 및 rPCR는 83.9%와 90.3%, 각각이었다. 개별적인 견본 근거한 분석에, 문화 방법은 78 MG 양성 혈청 닭 (감도 33%, 특이성 100%년) 중에서 rPCR가 78마리의 MG 양성 혈청 닭 (감도 65%, 특이성 96%) 중에서 51장의 검출했더라도 반면, 26장의 검출했다. 혈청학 사이 91.9%와 91.4%가 계약과 문화, 와 혈청학과 rPCR, 각각 있었다. 이 연구 결과의 결과는 향상한 생체외 탐지 한계를 가진 rPCR가 양성 혈청 닭 무리에 있는 MG를 검출할 수 있었다는 것을 나타낸다. 그러므로, 우리는 rPCR의 사용을 조언하고 그리고/또는 닭 무리에 있는 검열 MG 감염에서 얻어진 혈청학 결과의 확인을 위해 경작한다.

PMID: - 발행인에 의해서 공급되는 - 20149561 [PubMed]

Fasciola 종의 ID를 위한 특정 PCR 근거한 분석실험: 보급 조사에 있는 그들의 발달, 평가 및 잠재력 유용성.

앤 Trop Med Parasitol. 1월 2010일; 104 (1): 65-72

저자: Ai L, Dong SJ, 장 WY 의 Mahmmod YS, 린 RQ, Yuan ZG, Shi YL, Huang WY, 주 XQ, Elsheikha HM

중국에 있는 반추 동물을 감염해 기생충 사이에서 속 Fasciola에 속하는 3개의 taxa이십시오: F. hepatica, F. gigantica 및 이러한 두 종류 종 사이에서 속이는 것처럼 보이는 소위 "중간 양식". 기생충의 핵 ribosomal DNA (rDNA) 내의 두번째 내부 베껴진 간격 장치 (ITS-2)의 순서에 기초를 두어, F. hepatica를 위한 뇌관 (DSJf/DSJ3) 특성과 F. gigantica를 위한 쌍 (DSJf/DSJ4) 특성의 쌍은 디자인되고 발전하기 위하여 사용해 분석실험의 PCR 기초를 두었다. 이 분석실험은 이종 DNA 견본에서 일어난 amplicons 없이 F. hepatica, F. gigantica 및 "중간" Fasciola의 ID 그리고 감별법을, 허용했다. 연속의 결과는 증폭한 제품의 species-specific 신원을 확인했다. 분석실험은 F. hepatica DNA의 0.11 ng 및 F. gigantica DNA의 0.35 ng 처럼 적었던을 가진 긍정적 결과를 주는 좋은 감도를 보여주었다. 이것은 단 하나 Fasciola 계란 단 하나 감염한 달팽이에게서 DNA가 Fasciola taxon의 ID를 위해 다는 것을 의미했다. 개발한 PCR 분석실험은 인간에 있는 Fasciola 감염의 탐지를 위한 유용한 툴을, ID 및 역학 수사, 다른 포유동물 및 달팽이 제공할 수 있었다.

PMID: 20149293 [PubMed - 프로세스에서 -]

Pp65 antigenemia, 플라스마 실시간 PCR 및 DBS는 징후와 징후가 없는 세포 확대 바이러스 선천적으로 감염한 newborns에서 시험한다.

BMC는 Dis를 감염한다. 2월 2010일 11일; 10 (1): 24

저자: Binda S, Mammoliti A, Primache v 의 까불기 P, Corbetta C, Mosca F, Pugni L, Bossi A, Ricci C, Barbi M

요약: 배경: 많은 것은 가혹한 결과의 위험한 상태에 선천적으로 세포 확대 바이러스 감염한 (cCMV) 신생아 비록 출생시 징후가 없더라도, 이다. 신생아 혈액에 있는 바이러스성 짐의 평가는 후유증의 위험한 상태에 아기 확인에서 도울 수 있었다. 방법: 존재하는 연구 결과에서는, 우리는 결과 cCMV에게서 소변 테스트를 통해 생활의 첫번째 2 주에서 진단하는을 가진 22명의 징후와 48명의 징후가 없는 newborns 모아진 혈액 샘플에 얻어진 부연 설명했다. 우리는 2개의 양이 많은 방법 (pp65 antigenemia 시험과 플라스마 실시간 PCR)와 바이러스성 짐 측정을 위한 유효한 방법 확인의 목표에 있는 건조된 피 견본 (DBS) 시험의 semi-quantitative 결과의 성과를 평가했다. 결과: 플라스마 qPCR와 DBS 시험은 케이스의 100%년, 81%에 있는 antigenemia에 긍정적이었다. 후반 시험만 징후가 없는 아이들 대 징후에 있는 양이 많게 다른 결과를 주었다. 1E+03 copies/ml의 qPCR 가치는 신생의 52%에서 찾아냈다. "강한" DBS 시험 적극 케이스 "에는 약한" 적극을 가진 케이스 보다는 pp65 긍정적인 PBL 및 DNA 둘 다 copies/ml의 더 높은 중앙값이 있었다. 결론: 예상했던대로 antigenemia 시험은 분자 시험 및 DBS 시험이 pp65 긍정적인 PBL 및 DNA copies/ml의 최상의 고가로 견본에 잘 실행했다 보다는 보다 적게 과민했다. 이 시험의 결과의 예후 중요성은 이 아이들의 속행 데이터의 진행하는 수집의 완료에 평가될 것이다.

PMID: - 발행인에 의해서 공급되는 - 20149232 [PubMed]

양이 많은 즉시 PCR와 녹기 곡선 분석에 의해 결정되는 HELLP 증후군 환자에 있는 Leptin 수용체 (LEPR) SNP 동질다상.

BMC Med Genet. 2월 2010일 11일; 11 (1): 25

저자: Varkonyi T 의 Lazar L, Molvarec A, NG 보다는, Rigo J, Nagy B

요약: 배경: 몇몇 연구 결과는 자간전증 (PE)와 용혈, 높은 간 효소, 낮은 혈소판 (HELLP) 증후군에서 microarray 실험에 있는 leptin의 overexpression를 보여주었다. 우리는 양이 많은 즉시 PCR와 녹는 곡선 분석을 사용해서 HELLP 증후군 환자에 있는 4개의 leptin 수용체 (LEPR) SNP 동질다상을 공부하는 것을 결정했다. 방법: DNA는 83명의 정상 혈압 임신부 및 75명의 HELLP 증후군 환자에게서 혈액 샘플에서 고립되었다. 4 SNPs, LEPR c.326A>G (K109), LEPR c.668A>G (Q223R), LEPR c.1968G>C (K656N) 및 LEPR c.3024A>G (S1008)는 양이 많은 즉시 PCR와 녹는 곡선 분석에 의해 결정되었다. 조사자는 임상 결과에 눈 멀게 했다. 결과: LEPR c.326A>G, LEPR c.668A>G, LEPR c.1968G>C 및 LEPR c.3024A>G 대립 유전자는, 인자형 및 haplotype 동질다상 HELLP 증후군 환자와 정상 혈압 건강한 pregnants에서 다르지 않았다. 소재시 c.326A>G와 c.6687A>G (D'= 0.974) 사이 강한 결합 불균형 (LD), 그리고 c.668A>G 및 c.1968G>C (D = 0.934), 및 c.326A>G 및 c.1968G>C (D = 0.885), 및 c.1968G>C 및 c.3024A>G (D = 1.0)가 있었다. 그러나, c.668A>G (D = 0.111)와 c.326A>G (D'= 0.398)를 가진 c.3024A>G의 결합은 약했다. 강건한 Weinberg 평형은 모든 동질다상을 위해 관찰되었다. 그러나 LEPR c.326A>G AG 인자형은 두번 더 빈번하 (AG AG GG AG) haplotype는 3 HELLP 증후군 환자에서 시간 더. 녹는 곡선 분석과 결합된 소개한 양이 많은 즉시 PCR는 LEPR SNPs의 결심을 위한 빠른 확실한 방법이다. 결론: 특정 LEPR haplotypes가 HELLP 증후군에서 더 빈번하더라도, 우리는 4개가 HELLP 증후군의 발달과 관련되었던 LEPR SNP 동질다상을 공부했다 강력한 증거가 다는 것을 결론진다.

PMID: - 발행인에 의해서 공급되는 - 20149225 [PubMed]

실시간 PCR에 있는 DNA와 실시간 반전 녹음방송 PCR 분석실험에 있는 RNA로 사용을 위한 다재다능한 내부 제어.

Lett Appl Microbiol. 1월 2010일 22일;

저자: 사슴 DM 의 Lampel KA, González Escalona N

요약은 조준한다: 분석실험 금지의 존재를 확인하고 기존 qPCR로 그것의 합동 및 세균성 탐지를 위한 qRT PCR 방법을 평가하기 위하여 실시간 PCR (qPCR)에 있는 반전 녹음방송 실시간 PCR (qRT PCR)에 있는 DNA로 또는 RNA로 이용될 수 있는 TaqMan 근거한 내부 확대 통제 (IAC)를 평가하기 위하여 개발하고. 방법과 결과: DNA IAC는 pZErO-2 선그림으로 종합되고 삽입되고 대장균으로 변형된 198 bp 임의 순서를 생성하 구성되었다. RNA IAC는 DNA IAC의 생체외 녹음방송을 통해서 생성되었다. 두 IAC 체재 다 singleplex TaqMan 반응에서 개별적으로 시험되고 또한 기존 다중 분석실험에서 포함되었다. DNA IAC는 (ipaH를 표적으로 하는) Shigella spp. 탐지 qPCR 분석실험에서 통합되었다. RNA IAC는 살모넬라 spp. 탐지 qRT PCR에서 성공적으로 평가되었다 (표적으로 invA mRNA를 사용하는). 결론: qPCR에 보충될 수 있고 qRT PCR가 병원체 검출 방법 개발된 매우 병원체 탐지에 영향을 미치기 없이 PCR 억제물 때문에 틀린 네거티브의 혼동 효력을 감소시키는 높게 다재다능한 IAC. 연구 결과의 중요성 그리고 충격: 틀린 네거티브의 주파수는 qPCR 분석과 특정 매트릭스, 복잡한 음식을 포함하는 특히 그들에서 널리 퍼지다 관련시켰다. 그러므로, 여기에서 제출된 IAC는 PCR에 있는 의외 틀리 부정적인 반응에 해결책을 제공한다.

PMID: - 발행인에 의해서 공급되는 - 20149084 [PubMed]

저작권 2006-2007년 PCR 역