PCR de Kettingreactie van de Polymerase

PCR Protocollen

 

PCR Post

  Onlangs Gepubliceerde PCR dagelijks Bijgewerkte Documenten -

Opsporing van menselijke papillomavirus in pterygium en bindvliespapilloma door… Verwante Artikelen

Opsporing van menselijke papillomavirus in pterygium en bindvliespapilloma door hybride vangst II en PCR analyses.

Oog. 2008 Jun 6;

Auteurs: Takamura Y, Kubo E, Tsuzuki S, Akagi Y

AimTo licht de vemeende rol van menselijke papillomavirus (HPV) besmetting in nader toe pterygium en bindvliespapilloma.MethodsHybrid vangst II (hc-II) de analyses en van de polymerasekettingreactie (PCR) werden uitgevoerd om HPV in pterygium (42 steekproeven die uit 40 patiënten worden verkregen) en bindvliespapilloma (8 steekproeven van 6 patiënten) te ontdekken. De hoeveelheid DNA HPV werd geëvalueerde door meting van relatieve lichte eenheden (RLUs) op een luminometer.ResultsAll papillomasteekproeven was positief voor DNA HPV door PCR en hc-II. De waarden RLU voor specimens van terugkomende en re-terugkomende papilloma waren duidelijk hoger dan die voor specimens van primaire letsels. HPV werd ontdekt door PCR in 2 van 42 (4.8%) bèta-globin-positieve pterygiumspecimens, terwijl hc-II aantoonde dat HPV in alle pterygiumsamples.ConclusionsOur resultaten steunt de hypothese negatief was dat DNA HPV met de pathogenese van bindvliespapilloma, maar niet pterygium wordt geassoci�ërd. De meting RLU door HC-II kan als teller dienen voor de evaluatie van de activiteit van HPV in bindvliestumors. De vooruitgangs online publicatie van het oog, 6 Juni 2008; doi: 10.1038/eye.2008.176.

PMID: 18535585 [PubMed - zoals die door uitgever wordt geleverd]


Op pCR-gebaseerde methodologie voor moleculaire microchimerismopsporing en getalsmatige weergave. Verwante Artikelen

Op pCR-gebaseerde methodologie voor moleculaire microchimerismopsporing en getalsmatige weergave.

Med van Biol van Exp (Maywood). 2008 Jun 5;

Auteurs: Pujal JM, Gallardo D

Achtergrond: Rand bloedmicrochimerism na zwangerschap of stevige orgaanoverplanting is wijd bestudeerd maar een consensus bij de zijn opsporing is nog niet goedgekeurd. Doelstellingen: Om een paneel van reproduceerbare moleculaire op pCR-Gebaseerde methodes voor opsporing en getalsmatige weergave van buitenlandse cellen in een individu op te richten. Methodes: Wij analyseerden lengtepolymorfisme dat door STR en tellers VNTR wordt geproduceerd. Hla-a en - het polymorfisme van B werd ontdekt door RSCA. Klasse II werd polymorfisme op hla-DRB1 plaats geanalyseerd zowel door klassieke pcr-SSP als door kwantitatieve PCR (q-PCR). Ook, stond het gen SRY specifieke mannelijke donoronderscheid en getalsmatige weergave door Q-PCR toe in vrouwelijke ontvangers. De binomiale statistische distributieanalyse werd voor elke moleculaire techniek gebruikt om het aantal PCR her*halen van elke steekproef te bepalen. Deze analyse stond de opsporing van laagste opspoorbaar microchimerismniveau toe, toen heden. Vloeit voort: Wij konden microchimerism in meer dan 96% en meer dan 86% van gevallen op niveaus zo ontdekken laag zoals 1:10 e5 en 1:10 e6 donor per begunstigde cellen (DPRC) respectievelijk, gebruikend q-PCR voor SRY of voor niet-gedeelde hla-DRB1 alleles. Deze technieken toegestaan zo laag zoals 1 genoom-gelijkwaardige celopsporing. De lagere niveaus (nanochimerism) zouden kunnen ont*dekke maar niet wegens techniekbeperkingen worden gekwantificeerd. Enerzijds, stonden de klassieke PCR methodes neer opsporing aan 1:10 e4 DPRC voor toe hla-DRB1 ssp-PCR. De klinische toepassing van deze technieken in stevig orgaan plantte ontvangers getoond microchimerismniveaus die zich van 1:10 e4 aan 1:10 e6 DPRC na nier of hartoverplanting uitstrekken, en 1 hoger logboek over (1: 10e3 aan 1:10 e6 DPRC) na leveroverplanting. Conclusie: De normalisatie van de moleculaire technieken van de microchimerismopsporing zal voor vergelijkbare interpretatie van resultaten in microchimerismopsporing voor kenmerkende of onderzoekstudies toestaan.

PMID: 18535170 [PubMed - zoals die door uitgever wordt geleverd]


PCR serie in real time aan studiegevolgen van chemische producten voor hypothalamic-Pituita… Verwante Artikelen

PCR serie in real time aan studiegevolgen van chemische producten voor de hypothalamic-slijmachtig-Gonadal as van Japanse medaka.

Aquat Toxicol. 2008 24 April;

Auteurs: Zhang X, Hecker M, Park JW, Tompsett AR, Newsted J, Nakayama K, Jones PD, Au D, Kong R, Wu RS, Giesy JP

Dit document beschrijft de ontwikkeling en de bevestiging van een PCR serie voor het bestuderen van chemisch-veroorzaakte gevolgen voor genuitdrukking van geselecteerde endocriene wegen langs de hypothalamic-slijmachtig-gonadal as (van HPG) van de kleine, oviparous vissen, Japanse medaka (Oryzias latipes). De Japanse serie van medaka hpg-PCR combineert de kwantitatieve prestaties van (R) groen-Gebaseerde PCR SYBR die in real time met het veelvoudige gen mogelijkheden van microarray profileert om uitdrukkingsprofielen van 36 genen te onderzoeken verbonden aan endocriene wegen in hersenen, lever en gonade. De prestaties van de Japanse serie van medaka hpg-PCR werden geëvalueerd) door gevolgen van twee modelsamenstellingen, het synthetische oestrogeen, 17alpha-ethinylestradiol (EE2) en anabole androgen, 17beta-trenbolone (TRB) op de as HPG van Japanse medaka te onderzoeken. Vier-maand-oude medaka werd blootgesteld aan drie concentraties van EE2 (5, 50, 500ng/L) of TRB (50, 500, 5000ng/L) voor 7d in een statisch systeem van de vernieuwingsblootstelling. Een op weg-gebaseerde benadering werd uitgevoerd om mRNA uitdrukking afhankelijk van de concentratie in de as HPG van Japanse medaka te analyseren en te visualiseren. De compensatoire reactie op EE2 blootstelling omvatte de beneden-verordening van mannelijke hersenen GnRH RI en testicular CYP17. De beneden-verordening van AR-Alpha- uitdrukking in hersenen van eE2-Blootgestelde mannetjes werd geassoci�ërd met afschaffing van mannelijk seksueel gedrag. De compensatoire reacties op TRB in de vrouwelijke as HPG omvatten omhoog-verordening van hersenen GnRH RII en eierstok steroidogenic CYP19A. Globaal, stelden de resultaten voor dat de Japanse serie van medaka hpg-PCR potentieel niet alleen als onderzoekshulpmiddel van potentiële endocrien-onderbreekt chemische producten maar ook in het nader toelichten van mechanismen van actie heeft.

PMID: 18534694 [PubMed - zoals die door uitgever wordt geleverd]


Een efficiënte methode voor reiniging van PCR producten voor het rangschikken. Verwante Artikelen

Een efficiënte methode voor reiniging van PCR producten voor het rangschikken.

Biotechniques. 2008 Jun; 44 (7): 921-3

Auteurs: Ma H, Difazio S

Een hoog-productieDNA die methode rangschikt die de gegevens produceerde van uitstekende kwaliteit werd ontwikkeld. Een frame dat van een standaardagarose gel wordt gevormd dat met 0.1%-0.2% punt (LMP) wordt gecombineerd agarose werd gel met een laag smeltpunt gebruikt om het PCR product van belang te isoleren. De verzamelde PCR producten werden gecentrifugeerd zonder enige reagentia en supernatants werden direct gebruikt voor een het rangschikken reactie. Deze methode is eenvoudig en efficiënte arbeid, verstrekt de opeenvolgingen van uitstekende kwaliteit aan lage kosten, en mijdt problemen met onzuivere PCR producten. Deze techniek is gebruikt voor ontdekking de enige van het nucleotidepolymorfisme (SNP) in Populus angustifoliabomen.

PMID: 18533902 [PubMed - in proces]


Nauwkeurige en efficiënte gegevens - verwerking voor het kwantitatieve PCR gebruiken in real time… Verwante Artikelen

Nauwkeurige en efficiënte gegevens - verwerking voor kwantitatieve PCR die in real time een driezijdig installatievirus gebruiken als model.

Biotechniques. 2008 Jun; 44 (7): 901-12

Auteurs: Feng J, Zeng R, Chen J

PCR in real time wordt een aangewezen methode voor getalsmatige weergave van minieme hoeveelheden nucleic zuren. Om het volledige potentieel van deze techniek te bereiken, worden de nauwkeurige en geschikte modellen voor post-PCR- gegevensanalyse vereist. In deze studie, werden drie verschillende modellen verkozen om de definitieve exemplaaraantallen het mozaïekvirus van Komkommer (CMV) genomic RNAs te kwantificeren gebruikend ruwe fluorescentiegegevens van PCR in real time, en de vergelijkingen werden voorgesteld om hun uitdrukkingsniveaus in virions of in planta te vergelijken. De resultaten, zoals die door standaardkromme en Noordelijke bevlekkende methodes worden bevestigd, tonen aan dat de uitdrukkingsniveaus van verschillende genen nauwkeuriger en efficiënter door deze vergelijkingen kunnen worden vergeleken, vooral gebruikend theoretische die fluorescentie (F0) en kaliberbepalingsfactoren (CF), door lineaire regressiePCR wordt het bepaald (LinRegPCR). Aldus, kunnen deze vergelijkingen, die met gegevensanalyse door de methode LinRegPCR worden gecombineerd, de capaciteit van de hoog-productiegetalsmatige weergave van PCR in real time zeer verbeteren, en nauwkeurig, betrouwbaar, en vlot onderzoek van de veranderingen in CMV accumulatie toelaten RNAs.

PMID: 18533900 [PubMed - in proces]