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  Papéis recentemente publicados de PCR - diário atualizado

A deteção do papillomavirus humano no pterígio e no papiloma conjunctival por… relacionou artigos

Deteção do papillomavirus humano no pterígio e no papiloma conjunctival pela captação hybrid II e pelos assays de PCR.

Olho. 2008 junho 6;

Autores: Takamura Y, Kubo E, Tsuzuki S, Akagi Y

AimTo elucidate o papel putative da infecção humana do papillomavirus (HPV) no pterígio e a captação conjunctival II de papilloma.MethodsHybrid (HC-II) e os assays da reação chain do polymerase (PCR) foram executados para detectar HPV no pterígio (42 amostras obtidas de 40 pacientes) e no papiloma conjunctival (8 amostras de 6 pacientes). A quantidade de DNA de HPV foi avaliada pela medida de unidades claras relativas (RLUs) em amostras de um papiloma de luminometer.ResultsAll era positiva para o DNA de HPV por PCR e por HC-II. Os valores de RLU para espécimes do papiloma recurrent e re-recurrent eram marcada mais elevados do que aqueles para espécimes de lesions preliminares. HPV foi detectado por PCR em 2 de 42 (4.8%) espécimes beta-globin-positivos do pterígio, visto que HC-II mostrou que HPV era negativo em todos os resultados do pterígio samples.ConclusionsOur suporta a hipótese que o DNA de HPV está associado com o pathogenesis do papiloma conjunctival, mas não o pterígio. A medida de RLU por HC-II pode servir como um marcador para avaliar a atividade de HPV em tumours conjunctival. Eye a publicação em linha avançada, 6 junho 2008; doi: 10.1038/eye.2008.176.

PMID: 18535585 [PubMed - como fornecido pelo publisher]

metodologia PCR-baseada para a deteção e a quantificação molecular do microchimerism.

Biol Med de Exp (Maywood). 2008 junho 5;

Autores: Pujal JM, Gallardo D

Fundo: O microchimerism periférico do sangue depois que a gravidez ou o transplantation contínuo do órgão foram estudados extensamente mas um consenso em sua deteção não foi adotado ainda. Objetivos: Para estabelecer um painel de métodos PCR-baseados molecular reproducible para a deteção e a quantificação de pilhas extrangeiras em um indivíduo. Métodos: Nós analisamos os polymorphisms do comprimento gerados por STR e marcadores de VNTR. HLA-A e - os polymorphisms de B foram detectados por RSCA. Os polymorphisms da classe II no locus HLA-DRB1 foram analisados por PCR-SSP classical e por PCR quantitative (Q-PCR). Também, o gene de SRY permitiu a discriminação e a quantificação fornecedoras masculinas específicas por Q-PCR em receptores fêmeas. A análise estatística Binomial da distribuição foi usada para cada técnica molecular determinar o número de replicates de PCR de cada amostra. Esta análise permitiu a deteção do nível detectável o mais baixo do microchimerism, quando presente. Resultados: Nós poderíamos detectar o microchimerism mais em de 96% e mais de 86% dos casos nos níveis tão baixos quanto o doador de 1:10 e5 e de 1:10 e6 por as pilhas recipient (DPRC) respectivamente, usando Q-PCR para SRY ou para os alleles HLA-DRB1 non-compartilhados. Estas técnicas permitidas tão baixo quanto 1 deteção genome-equivalente da pilha. Uns níveis mais baixos (nanochimerism) poderiam ser detectados mas quantified devido às limitações da técnica. Na uma mão, os métodos classical de PCR permitiram a deteção para baixo a 1:10 e4 DPRC para HLA-DRB1 SSP-PCR. A aplicação clínica destas técnicas órgão contínuo nos receptores transplanted mostrados o microchimerism nivela variar de 1:10 e4 a 1:10 e6 DPRC após o transplantation do kidney ou do coração, e 1 registro mais altamente (1: 10e3 a 1:10 e6 DPRC) após o transplantation do fígado. Conclusão: A estandardização de técnicas molecular da deteção do microchimerism permitirá a interpretação comparável dos resultados na deteção do microchimerism para estudos do diagnostic ou da pesquisa.

PMID: 18535170 [PubMed - como fornecido pelo publisher]

Disposição Real-time de PCR para estudar efeitos dos produtos químicos na linha central Hypothalamic-Pituitary-Gonádica do medaka japonês.

Aquat Toxicol. 2008 abril 24;

Autores: Zhang X, Hecker M, parque JW, Tompsett AR, Newsted J, Nakayama K, paládio de Jones, Au D, Kong R, Wu RS, Giesy JP

Este papel descreve o desenvolvimento e o validation de uma disposição de PCR para estudar efeitos produto-induzidos na expressão do gene de pathways selecionados do endocrine ao longo da linha central (HPG) hypothalamic-pituitary-gonádica dos peixes pequenos, oviparous, o medaka japonês (latipes de Oryzias). A disposição japonesa do medaka HPG-PCR combina o desempenho quantitative de SYBR (R) PCR real-time Verde-baseado com o gene múltiplo que perfila potencialidades de um microarray para examinar perfis da expressão de 36 genes associados com os pathways do endocrine no cérebro, no fígado e no gonad. O desempenho da disposição japonesa do medaka HPG-PCR foi avaliado examinando efeitos de dois compostos modelo, do estrogen sintético, de 17alpha-ethinylestradiol (EE2) e do androgen anabolic, 17beta-trenbolone (TRB) na linha central de HPG do medaka japonês. o medaka Quatro-mês-velho foi exposto a três concentrações de EE2 (5, 50, 500ng/L) ou de TRB (50, 500, 5000ng/L) para 7d em um sistema de estática da exposição da renovação. Uma aproximação pathway-baseada foi executada para analisar e visualizar a expressão concentration-dependent do mRNA na linha central de HPG do medaka japonês. A resposta compensatory à exposição EE2 incluiu o para baixo-regulamento do cérebro masculino GnRH RI e CYP17 testicular. O para baixo-regulamento da expressão do AR-alfa no cérebro de machos de EE2-exposed foi associado com a supressão do comportamento sexual masculino. As respostas Compensatory a TRB na linha central da fêmea HPG incluíram o acima-regulamento do cérebro GnRH RII e do ovary CYP19A steroidogenic. Totais, os resultados sugeriram que a disposição japonesa do medaka HPG-PCR tem o potencial não somente como uma ferramenta da seleção de produtos químicos endocrine-disrupting do potencial mas também em elucidating mecanismos da ação.

PMID: 18534694 [PubMed - como fornecido pelo publisher]

Um método eficiente para o purification de produtos de PCR para arranjar em seqüência.

Biotechniques. 2008 junho; 44 (7): 921-3

Autores: Miliampère H, Difazio S

Um DNA do elevado-throughput que arranja em seqüência o método que gerou dados da alta qualidade foi desenvolvido. Um frame formado de um gel padrão do agarose combinado com os 0.1%-0.2% gel dederretimento do agarose do ponto (LMP) foi usado isolar o produto de PCR do interesse. Os produtos coletados de PCR centrifuged sem nenhuns reagents e os supernatants foram usados diretamente para uma reação arranjando em seqüência. Este método é eficiente simples e labor, fornece seqüências da alta qualidade em um custo baixo, e contorneia problemas com os produtos impure de PCR. Esta técnica foi usada para a única descoberta do polymorphism do nucleotide (SNP) em árvores do angustifolia de Populus.

PMID: 18533902 [PubMed - no processo]

Processo de dados exato e eficiente para o real-time quantitative PCR usando um vírus tripartite da planta como um modelo.

Biotechniques. 2008 junho; 44 (7): 901-12

Autores: Feng J, Zeng R, Chen J

PCR Real-time está transformando-se um método preferido para a quantificação de quantidades minuciosas de ácidos nucleic. Para conseguir o potencial cheio desta técnica, os modelos exatos e convenientes para a análise de dados do borne-PCR são requeridos. Neste estudo, três modelos diferentes foram escolhidos quantify os números definitive da cópia do vírus do mosaic do pepino (CMV) RNAs genomic usando dados crus do fluorescence de PCR real-time, e as equações foram propostas comparar seus níveis da expressão nos virions ou no planta. Os resultados, como confirmados pela curva padrão e por métodos borrando do norte, mostram que os níveis da expressão de genes diferentes podem ser comparados mais exatamente e mais eficientemente por estas equações, especial usando o fluorescence teórico (F0) e os fatores da calibração (CF), determinados pela regressão linear PCR (LinRegPCR). Assim, estas equações, combinadas com a análise de dados pelo método de LinRegPCR, podem extremamente realçar a abilidade da quantificação do elevado-throughput de PCR real-time, e permitem a investigação exata, de confiança, e facile das mudanças CMV na acumulação de RNAs.

PMID: 18533900 [PubMed - no processo]

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