Цепная реакция полимеразы PCR

Протоколы PCR

 

Станция PCR

  Нов опубликованные бумаги PCR - уточненная повседневность

Обнаружение людского papillomavirus в pterygium и conjunctival papilloma… отнесло статьи

Обнаружение людского papillomavirus в pterygium и conjunctival papilloma гибридным захватом II и assays PCR.

Глаз. 6-ое июнь 2008;

Авторы: Takamura y, Kubo e, Tsuzuki s, Akagi y

AimTo разъясняет putative роль людской инфекции papillomavirus (HPV) в pterygium и conjunctival захват II papilloma.MethodsHybrid (HC-II) и assays цепной реакции полимеразы (PCR) были выполнены для того чтобы обнаружить HPV в pterygium (42 образцах полученных от 40 пациентов) и conjunctival papilloma (8 образцах от 6 пациентов). Количество ДНАА HPV было оценено измерением относительных узлов освещения (RLUs) на образцах papilloma luminometer.ResultsAll было положительно для ДНАА HPV PCR и HC-II. Значения RLU для образцов возвратного и re-возвратного papilloma были маркированно более высоки чем значенидля образцов главным образом убытоков. HPV было обнаружено PCR в 2 из 42 (4.8%) бета-globin-положительных образцов pterygium, тогда как HC-II показало что HPV было отрицательным в всех результатах pterygium samples.ConclusionsOur поддерживает предположение что ДНАО HPV связано с патогенезом conjunctival papilloma, но не pterygium. Измерение RLU HC-II может служить как отметка для оценивать RABOTу HPV в conjunctival туморах. Издание глаза предварительное online, 6-ое июня 2008; doi: 10.1038/eye.2008.176.

PMID: 18535585 [PubMed - как поставлено издателем]


PCR-основанная методология для молекулярных обнаружения и квантификации microchimerism. Родственные статьи

PCR-основанная методология для молекулярных обнаружения и квантификации microchimerism.

Biol Med Exp (Maywood). 5-ое июнь 2008;

Авторы: Pujal JM, Gallardo d

Предпосылка: Периферийное microchimerism крови после того как стельность или твердая трансплантация органа широко были изучены только консенсус на своем обнаружении пока не были приняты. Задачи: Установить панель возпроизводимых молекулярных PCR-основанных методов для обнаружения и квантификации чужих клеток в индивидуале. Методы: Мы проанализировали полиморфизмы длины произведенные STR и отметки VNTR. HLA-A и - полиморфизмы b были обнаружены RSCA. Полиморфизмы типа II на локусе HLA-DRB1 были проанализированы и классическим PCR-SSP и количественным PCR (Q-PCR). Также, ген SRY позволил специфически мыжские donor различение и квантификацию Q-PCR в женских получателях. Двухчленный статистически анализ распределения был использован для каждого молекулярного метода для того чтобы обусловить число replicates PCR каждого образца. Этот анализ позволил обнаружение самого низкого обнаруженного уровня microchimerism, когда настоящий момент. Результаты: Мы смогли обнаружить microchimerism в больше чем 96% и больше чем 86% из случаев на уровнях как низких как даритель 1:10 e5 и 1:10 e6 согласно с реципиентные клетки (DPRC) соответственно, использующ Q-PCR для SRY или для, котор non-делят аллелей HLA-DRB1. Эти методы позволенные как низко как 1 геном-соответствующее обнаружение клетки. Lower level (nanochimerism) смогли быть обнаружены но квантифицированы из-за ограничений метода. С другой стороны, классические методы PCR позволили вплоть обнаружения до 1:10 e4 DPRC для HLA-DRB1 SSP-PCR. Клиническое применение этих методов в твердом органе трансплантировало получатели показанные уровни microchimerism колебаясь от 1:10 e4 к 1:10 e6 DPRC после трансплантации почки или сердца, и 1 журнал более высоко (1: 10e3 к 1:10 e6 DPRC) после трансплантации печенки. Заключение: Шаблонизация молекулярных методов обнаружения microchimerism позволит соответствующее толкование результатов в обнаружении microchimerism для изучений diagnostic или исследования.

PMID: 18535170 [PubMed - как поставлено издателем]


В реальном масштабе времени блок PCR для того чтобы изучить влияния химикатов на Гипоталамическом-Pituita… Родственные статьи

В реальном масштабе времени блок PCR для того чтобы изучить влияния химикатов на Гипоталамическ-Pituitary-Гонадной оси японского medaka.

Aquat Toxicol. 24-ое апр. 2008;

Авторы: Zhang x, Hecker m, парк JW, Tompsett AR, Newsted j, Nakayama k, палладиум Jones, Au d, Kong r, Wu RS, Giesy JP

Эта бумага описывает развитие и утверждение блока PCR для изучать химикат-наведенные влияния на выражении гена выбранных pathways эндокрина вдоль гипоталамическ-pituitary-гонадной оси (HPG) малых, oviparous рыб, японского medaka (latipes Oryzias). Японский блок medaka HPG-PCR совмещает количественное представление SYBR (r) Зелен-основанного в реальном масштабе времени PCR при множественный ген профилируя возможности microarray для того чтобы рассмотреть профили выражения 36 генов связанных с pathways эндокрина в мозге, печенке и гонаде. Проведение японского блока medaka HPG-PCR было оценено путем рассматривать влияния 2 модельных смесей, синтетического эстрогена, 17alpha-ethinylestradiol (EE2) и анаболитного андрогена, 17beta-trenbolone (TRB) на оси HPG японского medaka. 4-месяц-старое medaka подверглось действию до 3 концентрации EE2 (5, 50, 500ng/L) или TRB (50, 500, 5000ng/L) для 7d в статической системе выдержки возобновлением. Pathway-основанный подход был снабжен для того чтобы проанализировать и визуализировать concentration-dependent выражение mRNA в оси HPG японского medaka. Возмездная реакция к выдержке EE2 включила вниз-регулировку мыжского мозга GnRH RI и тестикулярного CYP17. Вниз-регулировка выражения AR-альфаы в мозге мужчин EE2-exposed была связана с подавлением мыжского сексуального поведения. Возмездные реакции к TRB в оси женщины HPG включили вверх-регулировку мозга GnRH RII и завязи steroidogenic CYP19A. Обще, результаты предложили что японский блок medaka HPG-PCR имеет потенциал not only как инструмент скрининга химикатов потенциала эндокрин-нарушая но также в разъяснять механизмы действия.

PMID: 18534694 [PubMed - как поставлено издателем]


Эффективный метод для очищения продуктов PCR для sequencing. Родственные статьи

Эффективный метод для очищения продуктов PCR для sequencing.

Biotechniques. 2008 июнь; 44 (7): 921-3

Авторы: Ma h, Difazio s

ДНАО высок-throughput sequencing метод произвел данные по highquality было начато. Рамка фасонируемая от стандартного геля агарозы совмещенного с 0.1%-0.2% низк-плавя гелями агарозы пункта (LMP) была использована для того чтобы изолировать продукт PCR интереса. Собранные продукты PCR были центрифугованы без VSех реагентов и supernatants сразу были использованы для sequencing реакции. Этот метод просто и трудные эффективные, обеспечивает последовательности highquality на низкой цене, и обходит проблемы с impure продуктами PCR. Этот метод был использован для одиночного открытия полиморфизма нуклеотида (SNP) в валах angustifolia Populus.

PMID: 18533902 [PubMed - в процессе]


Точный и эффективный ввод информации для количественного использования real-time PCR… Родственные статьи

Точный и эффективный ввод информации на количественный real-time PCR использующ трехраздельный вирус завода как модель.

Biotechniques. 2008 июнь; 44 (7): 901-12

Авторы: Feng j, Zeng r, Chen j

В реальном масштабе времени PCR будет предпочитаемым методом для квантификации мельчайшего количества нуклеиновых кислот. Достигают полного потенциала этого метода, точные и удобные модели для анализ информации столба-PCR NEOBXODIMY, что. В этом изучении, 3 по-разному модели были выбраны для того чтобы квантифицировать окончательные номера экземпляра вируса мозаики огурца (CMV) genomic RNAs использующ сырцовые данные по флуоресцирования в реальном масштабе времени PCR, и были предложены, что сравнили уровнения их уровни выражения в virions или в planta. Результаты, как подтвержено стандартной кривым и северными blotting методами, показывают что уровни выражения по-разному генов могут быть сравнены точно и эффективно этими уровнениями, специально использующ теоретическое флуоресцирование (F0) и факторы тарировки (CF), обусловленные линейнаяа регрессия PCR (LinRegPCR). Таким образом, эти уровнения, совмещенные с анализ информации методом LinRegPCR, могут больш увеличить способность квантификации высок-throughput в реальном масштабе времени PCR, и позволяют точное, надежное, и facile исследование изменений в CMV накоплении RNAs.

PMID: 18533900 [PubMed - в процессе]