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Wuchereria在蚊子的bancrofti L3幼虫的检测： 反向Transcri… 相关条款
Wuchereria在蚊子的bancrofti L3幼虫的检测： 反向Transcriptase PCR检验评估的传染和感染。
PLoS Negl Trop Dis。 2010年; 4 (2) ：e602
作者： Laney SJ， Ramzy RM， Helmy HH， Farid HA， Ashour AA， Weil GJ， SA威廉斯
背景： 丝虫的脱氧核糖核酸的检测在蚊子的由PCR不可能区分从被传染的蚊子的传染性蚊子。 为了评估传输冒一个检验的风险是需要的能特别地检测传染性L3阶段寄生生物。 我们现在报告特别地检测Wuchereria bancrofti传染性阶段在蚊子的检验的发展。 检验由反向transcriptase PCR (RT-PCR)检测一本L3被激活的mRNA抄本。 METHODOLOGY/PRINCIPAL发现： W. bancrofti表皮相关基因被选择了使用分析复杂生物资料的学科并且筛选了作为L3检测的潜在的诊断目标基因在蚊子。 表达式配置文件使用在与蚊子查出的核糖核酸的RT-PCR是确定的每日收集在一个两星期期间间在提供在被传染的血液以后。 使用L3检测的一本L3被激活的cuticlin抄本和一本结构性地表示的抄本， tph-1， ‘任何阶段’检测的，常规复合RT-PCR和实时复合RT-PCR检验被开发了。 CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE ： 此检验可以被用于同时检测W. bancrofti传染性阶段幼虫和‘在合并的向量蚊子的任何阶段’幼虫。 当为估计的一个工具在传输潜在更改在丝虫病清除程序中，此测试可能是有用的。
PMID ： 20169115 [PubMed -在进程中]
商业PCR酵素污秽提高质量的重要性…的HIV涉及条款
商业PCR酵素的HIV污秽提高便宜的机构内部的基因型HIV药物抗性测试质量管理的重要性。
那里Antivir。 2010年; 15 (1) ：121-6
作者： Monleau M， Plantier JC， Peeters M
背景： 基因型药物抗性测试使用试剂的便宜的机构内部的技术与仅研究的质量标签。 这里，我们报告关于PCR放大作用的结果在二个独立实验室被观察的负控制的。 方法： 在血粉和等离子地点的在负控制范例被观察了和PCR详细分析蛋白酶的正PCR放大作用和HIV基因型药物抗性测试的反向transcriptase片段和顺序和种系发生的分析识别PCR污秽的始发地。 结果： 详细的分析显示RT-PCR酵素沾染了与同一家公司商业化的一个基于HIV的向量。 结论： 这些观察显示需要实施使用机构内部的协议，为缺乏在新的试剂批的HIV验证的质量管理步骤，因为这可能极大减弱HIV和基因型药物抗性测试分子诊断。
PMID ： 20167998 [PubMed -在进程中]
新颖的检测变化商谈的resista的混杂格式实时PCR检验… 相关条款
新颖的检测对三氮二烯伍圆的变化商谈的抵抗的混杂格式实时PCR检验在曲霉菌多三氮二烯伍圆抵抗的fumigatus和流行在临床孤立之中的在荷兰。
J Antimicrob Chemother。 2月2010日18日;
作者： Klaassen CH， de Valk HA， Curfs-Breuker IM， Meis JF
目的此研究的目标是： (i)学习三氮二烯伍圆抗性曲霉菌fumigatus孤立的流行在荷兰; 并且(ii)设计迅速实时PCR方法识别这样孤立。 方法A新颖的混杂格式实时PCR检验为导致三氮二烯伍圆抵抗的变化的检测被描述在A. fumigatus。 一套PCR初级读本和运载一个唯一萤光标签的探测与一个双股的脱氧核糖核酸荧光染料的组合允许(a)特定变化的同时检测并且担当一个内部放大作用控制的被放大的产品。 方法被运用了于209临床孤立的任意收藏从遍及荷兰和与显形感受性测试比较。 发生总共四三氮二烯伍圆抗性孤立被识别，造成抗性孤立的流行<2%。 全部四孤立包含了导致多三氮二烯伍圆抵抗的变化的一个相同的组合，如以前报告由其他。 分子检验结果是100%一致与显形感受性测试。 结论，虽然在特定患者人数抵抗的流行在A. fumigatus的可能是一个涌现的问题，在总人口它仍然是相对地低的。 新颖的实时PCR格式允许这样的迅速和可靠的确定孤立。
PMID ： 20167588 [PubMed -如供应发布人]
与羊似的牛奶查出的coagulase-negative葡萄球菌的确定s… 相关条款
与羊似的牛奶范例查出的coagulase-negative葡萄球菌的确定由16S rRNA和空白基因PCR-RFLP。
狩医Microbiol。 1月2010日28日;
作者： Onni T，桑纳布G， Cubeddu GP， Marogna G， Lollai S， Leori G， Tola S
导致羊似的传染的coagulase-negative葡萄球菌(CNS)的确定依然是有问题，虽然这些细菌被认为临床症状不显的乳腺炎主要病因论座席在绵羊和山羊的。 在此研究中， 226 CNS孤立从属于与高体细胞计数评分的15群的2201只挤奶的鲣类绵羊收集了。 所有孤立从属于对与API葡萄球菌ID测试的确定，然后对葡萄球菌的16S rRNA和空白基因的放大作用由PCR检验。 空白基因从属于对限制片段长度与限制核酸内切酶AluI的多形性分析，而16S rRNA基因从属于对与限制核酸内切酶RsaI、PstI和AluI的核醣体的指纹识别。 当CNS孤立的PCR-RFLP模式是与那些他们的参考张力不同，空白基因amplicons为明确确定排序。 API葡萄球菌ID测试，在对基因型确定方法的替代，导致了显著地不同的结果根据在每个组之内被识别的种类。 使用PCR-RFLP检验，大多孤立与葡萄球菌epidermidis的类型张力(131一起成群了，与57.9%相应)，被S. caprae (34，与15%相应)和S. chromogenes (30按照，与13.2%相应)。 总而言之， 16S rRNA PCR-RFLP检验和空白基因比导致绵羊乳腺炎的CNS的确定的API葡萄球菌ID测试是一个更加可靠和更加再现的方法。
PMID ： 20167442 [PubMed -如供应发布人]
促进者对O6 methylguanine脱氧核糖核酸在gl的methyltransferase的甲基化分析… 相关条款
促进者对O6 methylguanine脱氧核糖核酸在glioblastoma的methyltransferase的甲基化分析： 由锁着的核酸的检测根据定量PCR使用一个被印的基因(SNURF)作为参考。
BMC巨蟹星座。 2月2010日18日; 10 (1) ：48
作者： Morandi L， Franceschi E， De Biase D， Marucci G， Tosoni A， Ermani M， Pession A， Tallini G， Brandes AA
摘要： 背景： 外成沉默MGMT基因由促进者甲基化与MGMT表达式、减少的脱氧核糖核酸维修服务活动和在患者的更长的整体生存相关损失有，除放射疗法之外，接受与carmustine或temozolomide的烷基化的化疗的glioblastoma的。 我们描述并且验证一个迅速甲基化敏感定量PCR检验(女士qLNAPCR)使用锁着的核酸(LNA)被修改的初级读本和一个被印的基因作为参考。 方法： 分析做159名GBM患者数据库按照在2004年4月和2008年10月之间。 在亚硫酸氢盐处理，甲基化的和unmethylated CpGs以后由LNA初级读本和分子烽火台探测识别。 一个被印的基因的SNURF促进者在15q12映射了，作为参考使用了。 使用了此途径，因为被印的基因有甲基化的和unmethylated等位基因的一个平衡复制号码，并且此功能允许容易和准确的正常化。 结果： 在已经被描述的嵌套MS-PCR和女士qLNAPCR之间的和谐在158 159个范例中被找到(99.4%)。 女士qLNAPCR检验显示PCR效率102%和区分0.01% LNA的修改了初级读本，而非限定的初级读本显示了更低的效率(69%)和更低的区分(0.1%)。 在89个范例(55.97%)发现MGMT促进者甲基化使用70名患者的(44.02%)女士qLNAPCR和完全地unmethylated。 中间整体生存分别为24个月，是20个月和36个月，在有unmethylated和甲基化的MGMT的患者。 考虑MGMT甲基化数据由女士qLNAPCR提供了作为一个二进制变量，整体生存是不同的在有窝藏MGMT促进者的GBM范例的患者unmethylated和有MGMT甲基化(p=0.003)的所有百分比的其他病人之间。 此区别保留使用其他MGMT甲基化费率的被中断的值(即10%和20%甲基化的等位基因)，而区别丢失，当50% MGMT甲基化的等位基因使用了作为截止。 结论： 我们报告和临床验证甲基化的MGMT等位基因的检测和量化的一个准确，稳健和有效女士qLNAPCR协议在GBM范例的。 使用女士qLNAPCR我们显示出， MGMT促进者甲基化的甚而低水平必须被考虑到预测对temozolomide化疗的回应。
PMID ： 20167086 [PubMed -如供应发布人]
PCR放大作用和高分辨率融解弯曲分析作为一迅速diagnost… 相关条款
PCR放大作用和高分辨率融解弯曲分析作为一个迅速诊断方法给分枝杆菌属avium-intracellulare复杂的基因型成员。
Clin Microbiol传染。 2月2010日17日;
作者： Castellanos E， Aranaz A， De Buck J
某些分枝杆菌属avium-intracellulare (MAI)复杂的成员被认可作为在immunocompromised和免疫活性的患者的人力病原生物。 对基因型是可用的MAI复杂成员的当前分子方法可以是消耗大和技术上过分要求的。 在此报表，我们第一次描述一个实时PCR和高分辨率融解途径的应用区分在复杂成员之间通过瞄准PPE (赞成赞成Glu)基因系列， MACPPE24的亲属。 在此目标，分枝杆菌属avium亚种和分枝杆菌属intracellulare (M. intracellulare)的参考张力被用于优选技术。 然后，此实时PCR-HRM途径被用于区分10分枝杆菌属avium亚种hominissuis调遣从M. intracellulare参考张力的孤立。
PMID ： 20167007 [PubMed -如供应发布人]